GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BKM201 | MOLECULAR BIOLOGY AND GENETICS | Ders | 2 | 3 | 6,00 |
Dersin Seviyesi
Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
İngilizce
Dersin Amacı
Farklı organizmalarda gerçekleşen DNA replikasyonu, DNA tamiri, transkripsiyon, protein sentezi ve gen regülasyonu mekanizmalarının öğretilmesidir. Laboratuar uygulamasında bu mekanizmaların anlaşılması amacı ile kullanılan temel deneysel tekniklerin öğretilmesi amaçlanmaktadır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof. Dr. Serap Evran
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Moleküler biyoloji ve genetikte temel kavramları öğrenebilme |
| 2 | Prokaryotik ve ökaryotik DNA replikasyonu, DNA tamiri, transkripsiyon ve translasyon mekanizmalarını karşılaştırabilme |
| 3 | Moleküler biyolojide yaygın olarak kullanılan laboratuar tekniklerini öğrenebilme |
| 4 | Gen ekspresyonunun regülasyonunda farklı RNA türlerinin rollerini açıklayabilme |
| 5 | Temel moleküler biyoloji/genetik araştırmasını yürütebilecek bilgiyi kazanabilme |
| 6 | Bilimsel makaleleri yorumlayabilme |
| 7 | Spesifik bir moleküler biyoloji/genetik sorusunun çözümü için en uygun deneysel tekniği belirleyebilme |
| 8 | Biyokimyasal araştırmalarda moleküler biyolojik tekniklerin önemini anlayabilme |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Temel genetik, nükleik asitler, genler ve genomlar, replikasyon, transkripsiyon ve translasyon mekanizmaları, regulatör RNAlar, rekombinant DNA teknolojisine giriş
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Laboratuvar | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Moleküler Biyolojinin Tarihçesi, Genetiğe Giriş | Laboratuar oryantasyonu-I | Okuma Tartışma | |
| 2 | DNA yapısı (primer, sekonder ve tersiyer yapı) | Laboratuar oryantasyonu-II | ||
| 3 | Prokaryotik ve viral genom organizasyonu | Genomik DNA izolasyonu | ||
| 4 | Ökaryotik genom organizasyonu | Plazmid DNA izolasyonu (manuel) | ||
| 5 | Mobil DNA. Transpozonlar | Plazmid DNA izolasyonu (kit) | ||
| 6 | RNA yapısı | Agaroz jel elektroforezi | ||
| 7 | DNA replikasyonu | Polimeraz zincir reaksiyonu | ||
| 8 | Ara sınav | |||
| 9 | Transkripsiyon | Restriksiyon enzim kesimi | ||
| 10 | Transkripsiyon faktörleri ve gen ekspresyonunun kontrolü | Agaroz jelden DNA ekstraksiyonu | ||
| 11 | Ökaryotlarda transkripsiyonun regülasyonu. Epigenetik mekanizmalar. | Ligasyon | ||
| 12 | Translasyon | Kompetent hücre hazırlanması | ||
| 13 | RNA olgunlaştırma prosesleri | Transformasyon | ||
| 14 | DNA tamir mekanizmaları | Koloni PCR | ||
| 15 | Genomik. Moleküler genetik analiz. CRISPR/Cas9 Teknolojisi. | DNA dizi analizi | ||
| 16 | Final sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Watson, JD. (2013). Molecular Biology of the Gene, Benjamin Cummings Heather B. Miller, D. Scott Witherow, Sue Carson (2019) Molecular Biology Techniques: A Classroom Laboratory Manual, Academic Press Molecular Biology Problem Solver: A Laboratory Guide. Edited by Alan S. Gerstein, 2001, Wiley-Liss, Inc. Current Protocols Essential Laboratory Techniques Sean R. Gallagher (Editor), Emily A. Wiley (Editor), Wiley, 2008 Clark, DP. (2010). Molecular Biology, Academic Press. Jocelyn E. Krebs , Elliott S. Goldstein , Stephen T. Kilpatrick. Lewin's GENES 12th Edition Sue Carson, S.,Miller, H., Witherow, DS. (2011). Molecular Biology Techniques, Academic Press. Daniel L. Hartl (2018) Essential Genetics and Genomics 7th Edition Michael Goldberg, Janice Fischer, Leroy Hood, Leland Hartwell, Charles (Chip) Aquadro, Lee Silver and Ann E. Reynolds (2021) Genetics: From Genes to Genomes, 7th Edition
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 80 |
| Laboratuvar Sınavı | 1 | 20 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 2 | 28 |
| Laboratuvar | 14 | 2 | 28 |
| Soru-Yanıt | 14 | 1 | 14 |
| Deney | 14 | 2 | 28 |
| Rapor Hazırlama | 12 | 2 | 24 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 1 | 14 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 6 | 6 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 10 | 10 |
| Okuma | 10 | 2 | 20 |
| Laboratuvar Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 178 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 5 | 5 | 5 | 2 | 3 | 2 | 3 | 3 | 2 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 |
| ÖÇ 2 | 4 | 5 | 5 | 5 | 2 | 3 | 2 | 3 | 3 | 2 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 |
| ÖÇ 3 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 5 | 5 | 2 | 1 | 5 | 3 | 1 |
| ÖÇ 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 2 | 3 | 2 | 3 | 3 | 2 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 |
| ÖÇ 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 3 | 1 | 4 | 3 | 1 |
| ÖÇ 6 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 5 | 5 | 5 | 3 | 5 | 3 | 1 | 4 | 3 | 1 |
| ÖÇ 7 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 4 | 2 | 5 | 3 | 1 |
| ÖÇ 8 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 5 | 4 | 2 | 5 | 3 | 1 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek