GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BKM204 | BASIC TECHNIQUES IN BIOCHEMISTRY | Ders | 2 | 4 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
İngilizce
Dersin Amacı
Lisans düzeyinde temel biyokimyasal tekniklerin ve laboratuvar çalışma prensiplerinin öğretilmesi biyokimya eğitimi alan öğrenciler için bir zorunluluktur. Bu sayede öğrencilerin biyomoleküller ile çalışma deneyiminin kazandırılması ve öğrencilerin ileri düzeydeki biyokimyasal çalışmaları planlama ve pratik çalışmalara katılabilme yetisinin kazandırılması temel amaçtır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Dr. Öğr. Gör. Emre Erden
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Biyolojik moleküllerin ayırma ve analizlerinde temel teorik ve pratik konuları kullanabilme |
| 2 | Laboratuarda çalışabilme, biyokimyasal enstrumantasyon ve prosedurlerini kullanabilme becerisi |
| 3 | Biyokimyasal problemleri düşünebilme ve çözümleyebilme becerisi |
| 4 | Biyokimyasal problemlerin çözümünde takım çalışması yapabilme ve bağımsız çalışma becerisi |
| 5 | Verileri çözümleme, deney yapma ve tasarlama, yorumlayabilme |
| 6 | Bilimsel literatür tarama becerisi |
| 7 | Laboratuar defteri ve raporu hazırlayabilme, ilgili alanlarda uygulamalar için gerekli çağdaş teknikleri ve hesaplama araçlarını kullanabilme |
| 8 | Etkin bir şekilde sözlü ve yazılı iletişim kurabilme |
| 9 | Biyokimya ile ilgili alanlarda gerekli teknikleri ve araçları kullanabilme |
| 10 | Laboratuar güvenliği ve Biyogüvenliğin temel kuralları hakkında bilinc sahibi olabilme |
| 11 | Bilimse/akademik dürüstlük ve etik sorumlulık bilincine sahip olabilme |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Reaktif olarak su, laboratuar güvenliği ve biyogüvenlik, Laboratuar defteri ve rapor hazırlama, Biyolojik örneklerin hazırlanması, homojenizasyon /parçalama, santrifüj, membran filtrasyon teknikleri, çöktürme teknikleri, kromatografik yöntemler, elektroforetik yöntemler; protein (SDS-PAGE, IEF, 2D-PAGE) ve DNA elektroforezi, İmmünolojik teknikler
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Reaktif olarak su, Biyokimyasal deneyler için su tipleri ve saflaştırılması, Laboratuar güvenliği ve Biyogüvenlik, Laboratuar defteri ve raporlarının hazırlanması, Deney hataları, sonuçları grafiklendirilmesi vb. | ||
| 2 | Biyolojik örnek hazırlığı; olanaklar, kısıtlamalar, başlangıç materyalinin seçimi, Hücre parçalama ve homojenizasyon: uygun yöntemin seçimi, Homojenizasyon etkinliğinin belirlenmesi | ||
| 3 | Mekanik Yöntemler:Homogenizatörler, öğütücüler aşındırıcılar ile agitasyon, sıvı katı ekstrusyon, ultrasonikasyon, Kimyasal Yöntemler:ısı ile muamele, dondurma-eritme, desikasyon, ozmotik şok, litik enzimler, alkali ve deterjanlar ile muammele | ||
| 4 | Santrifüj; Teori, sınıflandırma, santrifüj tipleri, Diferansiyal Santrifüj, Yoğunluk Gradient Santrifüj, Membran Filtrasyon teknikleri | ||
| 5 | Ekstraktın deriştirilmesi: Ultrafiltrasyon, Liyofilizasyon, Çöktürme Yöntemleri( izoelektrik çöktürme, iyonik şiddeti değiştirerek çöktürme, organik çözgenler, Organik polimerler ve Denatürasyon ile çöktürme) | ||
| 6 | Kromatografik Yöntemler; Teori, uygulamalar, Kromatografi tipleri, Kağıt ve İnce Tabaka Kromatografisi ve sıvı kromatografisinde temel kavramlar ve teori, | ||
| 7 | Kromatografik Yöntemler; İyon değişim kromatografisi , Hidrofobik Etkileşim Kromatografisi, | ||
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | Kromatografik Yöntemler; Jel Filtrasyon Kromatografisi, Affinite kromatografisi: Biyospesifik, İmmunoafinite, Lektin afinite, Boya-ligant, Metal-Şelat, Kovalent afinite kromatografisi | ||
| 10 | Elektroforetik Yöntemler; Elektroforezin prensipleri, protein elektroforezi; PAGE, SDS-PAGE, IEF, 2D-PAGE. Blotlama, Immunustain, Görüntüleme, DNA elektroforezi | ||
| 11 | İmmunolojik Teknikler; (immunopresipitasyon, Immunoblotting, ELISA) | ||
| 12 | HPLC ve Uygulamaları | ||
| 13 | Entegrasyon ve karşılaştırma | ||
| 14 | Rehberli Problem Çözümü | ||
| 15 | Rehberli Problem Çözümü | ||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Keith Wilson and John Walker, Principles and Techniques of Biochemistry and Molecular Biology (2010) R. Boyer, Modern Experimental Biochemistry, Benjamin Cummings, (2000) R. Switzer, L. Garrity, Experimental Biochemistry, W. H. Freeman Company, (1999) D.J. Holme, H. Peck, Analytical Biochemistry, Prentice Hall, (1998) Gallagher, S.R. and Wiley E.A. Current Protocols Essential Laboratory Techniques, Wiley Press, (2008)
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 2 | 28 |
| Rehberli Problem Çözümü | 6 | 2 | 12 |
| Tartışma | 4 | 3 | 12 |
| Soru-Yanıt | 6 | 2 | 12 |
| Takım/Grup Çalışması | 6 | 4 | 24 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 15 | 15 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Okuma | 5 | 4 | 20 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 147 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 3 | 5 | 4 | 4 | 2 | 4 | 5 | 5 | 1 | 5 | 5 | 5 | 4 | 4 |
| ÖÇ 2 | 5 | 3 | 5 | 5 | 4 | 2 | 4 | 5 | 5 | 1 | 5 | 3 | 5 | 4 | 4 |
| ÖÇ 3 | 5 | 5 | 5 | 1 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 1 | 5 | 5 | 5 | 4 | 3 |
| ÖÇ 4 | 5 | 3 | 5 | 1 | 3 | 4 | 4 | 4 | 5 | 1 | 5 | 1 | 5 | 4 | 3 |
| ÖÇ 5 | 5 | 5 | 5 | 1 | 4 | 5 | 3 | 3 | 5 | 1 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 |
| ÖÇ 6 | 5 | 4 | 3 | 2 | 3 | 3 | 3 | 5 | 5 | 1 | 5 | 3 | 4 | 5 | 3 |
| ÖÇ 7 | 5 | 3 | 5 | 5 | 3 | 2 | 4 | 4 | 5 | 1 | 5 | 3 | 5 | 4 | 1 |
| ÖÇ 8 | 2 | 3 | 3 | 1 | 5 | 5 | 3 | 5 | 5 | 1 | 5 | 5 | 3 | 2 | 2 |
| ÖÇ 9 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 1 | 5 | 3 | 4 | 4 | 5 |
| ÖÇ 10 | 5 | 2 | 3 | 4 | 1 | 4 | 3 | 3 | 4 | 4 | 2 | 1 | 3 | 2 | 4 |
| ÖÇ 11 | 2 | 2 | 3 | 1 | 5 | 5 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 1 | 3 | 4 | 2 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek