GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BKM2404 | BIOPROCESS LABORATORY | Ders | 4 | 8 | 7,00 |
Dersin Seviyesi
Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
İngilizce
Dersin Amacı
Bu dersin amacı, öğrencilere temel biyoproses teknolojileri kavramları ilgili gerekli pratik beceri ve temel teknikleri vermektir.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğr. Gör. Dr. Emre ERDEN
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Mikrobiyal hücre kültüvasyonunda değişkenleri yorumlayabilme |
| 2 | Kültürde hücrelerin büyüme kinetiğini ve büyüme ve ürün oluşumu arasındaki dengeyi tanımlayabilme |
| 3 | Bilimsel literaturün taranmasında okuma ve biyoproses laboratuvarı hakkında bilginin yorumlanması yeteneğinin kazanabilme |
| 4 | Hedef metabolitin üretimi için planlama yapabilme |
| 5 | Hedef metabolit saflaştırılması için stratejiler geliştirebilme ve dizayn yapabilme yeteneğini kazandırabilme |
| 6 | Hedef metabolitin üretimi ve saflaştırılması için geleneksel teknikleri anlama ve uygulayabilme, kendini geliştirebilme |
| 7 | Biyoproses teknolojilerini alanında deneyim kazabilme |
| 8 | Takım çalışanı olarak etkili işbirliği yapabilme |
| 9 | Biyoproses teknolojilerinde özel teknikleri geliştirebilme |
| 10 | Uygulanan metotların avantaj ve dezavantajlarının karşılaştırarak yorumlama yeteneğinin kazanabilme |
| 11 | Uygun yöntem seçme becerisini kazanabilme |
| 12 | Bilimsel verilerin karşılaştırma, yorumlama ve değerlendirilebilmesi yeteneğini kazanabilme |
| 13 | Son verilerin takibini yapabilme |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Giriş, Hücre sayısının belirlenmesi, Suş geliştirme, Lab-ölçekli fermentasyon teknikleri (kesikli ve sürekli) ile metabololit üretimi (intra- ve ekstraselüler) ve saflaştırılması, Üretim profilinin belirlenmesi, Eksponensiyal büyüme modeli, Monod modeli, Verim katsayıları, Verimlilik, Fermentasyon prosesinin modellenmesi,
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Laboratuvar | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Ticari öneme sahip ürünlerin üretiminde kullanılan farklı tip mikroorganizmların (bakteri, maya ve fungus) kültivasyonu, | Laboratuar oryantasyonu | ||
| 2 | İnokulumun hazırlanması, kültür ortamının formülasyonu ve sterilizasyonu | Kültür ortamlarının hazırlanması ve materyallerin sterilizasyonu | ||
| 3 | Suş geliştirme yöntemleri: Rekombinant DNA Teknolojisi | Bateriden genomik DNA izolasyonu ve pET21a plasmidinin E. coli'den saflaştırılması | ||
| 4 | Kesikli kültürlerde rekombinant protein üretiminin temel basamakları ve gen klonlama | GFP kodlayan gen fragmentinin PCR ile amplifikasyonu | ||
| 5 | DNA'nın manipulasyonu | Saflaştırılan PCR ürünü ve plasmidin restriksiyon enzimleri ile kesilmesi | ||
| 6 | Ligasyon, kompetent hücre hazırlama ve transformasyon | Ligasyon, kompetent hücre hazırlama ve transformasyon | ||
| 7 | Koloni PCR, Kesikli kültürlerde Rekombinant E. coli'de GFP üretimi ve GFP'nin kalitatif analizi | Koloni PCR, Kesikli kültürlerde Rekombinant E. coli'de GFP üretimi ve GFP'nin kalitatif analizi | ||
| 8 | Ara sınav | |||
| 9 | Ticari öneme sahip enzimlerin kesikli kültürlerde fermentatif üretimi | Kültür ortamlarının hazırlanması ve materyallerin sterilizasyonu | ||
| 10 | Derin kültürde Beyaz çürükçül fungus Trametes trogii'den lakkaz üretimi | Optimum üretim şartlarının belirlenmesi: Karbon kaynağının etkisi | ||
| 11 | Derin kültürde Beyaz çürükçül fungus Trametes trogii'den lakkaz üretimi | Optimum üretim şartlarının belirlenmesi: Azot kaynağının etkisi | ||
| 12 | Kuru ağırlığa göre biyokütlenin tahmini; substrat ve ürün analizi | Karbon ve Azot kaynağının analizi, ürün konsantrasyonun ve lakkaz aktivitesinin tayini | ||
| 13 | Büyüme çalışması, çalkalamalı kültürlerde substrat kullanım ve ürün oluşum kinetikleri | Lakkaz oluşum kinetiklerinin hesaplanması | ||
| 14 | Fermantatif enzim üretiminde alt-akım işlemleri ve dolgu yatak reaktöründe immobilize lakkaz enzimi ile farklı tekstile boyar maddelerinin giderimi | Fermantasyon ortamlerından lakkaz enziminin saflaştırılması ve dolgu yatak reaktöründe immobilize lakkaz enzimi ile farklı tekstile boyar maddelerinin giderimi | ||
| 15 | Proje sunumu | Proje sunumu | ||
| 16 | Final sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Kitap önerisi yoktur.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 90 |
| Ev Ödevi | 1 | 10 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Quiz | 14 | 0 | 7 |
| Laboratuvar | 14 | 3 | 42 |
| Takım/Grup Çalışması | 14 | 3 | 42 |
| Deney | 14 | 3 | 42 |
| Rapor Hazırlama | 4 | 10 | 40 |
| Rapor Sunma | 4 | 5 | 20 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 3 | 3 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 3 | 3 |
| Okuma | 14 | 1 | 14 |
| Laboratuvar Ara Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Laboratuvar Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 217 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 4 | 3 | 3 | 5 | 1 | 5 | 2 | 4 | 1 | 2 | 5 | 5 | 3 | 5 |
| ÖÇ 2 | 5 | 4 | 4 | 1 | 5 | 2 | 5 | 2 | 4 | 1 | 2 | 5 | 5 | 3 | 5 |
| ÖÇ 3 | 5 | 5 | 5 | 2 | 5 | 1 | 5 | 2 | 4 | 1 | 2 | 4 | 5 | 3 | 5 |
| ÖÇ 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 5 | 5 | 5 | 1 | 2 | 3 | 5 | 4 | 5 |
| ÖÇ 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 3 | 5 | 5 | 5 | 1 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 |
| ÖÇ 6 | 5 | 5 | 4 | 2 | 3 | 3 | 5 | 5 | 5 | 1 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 |
| ÖÇ 7 | 5 | 5 | 4 | 2 | 3 | 1 | 5 | 2 | 5 | 1 | 3 | 4 | 5 | 3 | 5 |
| ÖÇ 8 | 5 | 3 | 3 | 2 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | 5 | 2 | 3 | 4 | 3 |
| ÖÇ 9 | 5 | 5 | 5 | 3 | 2 | 3 | 5 | 5 | 5 | 1 | 3 | 4 | 5 | 3 | 5 |
| ÖÇ 10 | 5 | 5 | 5 | 3 | 3 | 5 | 5 | 5 | 5 | 1 | 3 | 4 | 5 | 3 | 5 |
| ÖÇ 11 | 5 | 5 | 4 | 3 | 3 | 5 | 5 | 5 | 5 | 1 | 3 | 4 | 5 | 3 | 5 |
| ÖÇ 12 | 5 | 5 | 5 | 3 | 5 | 3 | 5 | 2 | 5 | 1 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 |
| ÖÇ 13 | 5 | 5 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 5 | 2 | 1 | 4 | 4 | 5 | 4 | 4 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek