GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 402054082008 | MOLEKÜLER EVRİM | Ders | 4 | 8 | 4,00 |
Dersin Seviyesi
Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Moleküler Evrim dersinin amacı, dört evrimsel gücün (mutasyon, göç, sürükleme ve seçilim) DNA diziliminde, günümüzde gözlenen çeşitliliği nasıl ürettiğini anlamaya çalışmak.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof. Dr. Aşkım Hediye ÇETİNEL
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Evrim teorisinin önemini ortaya koymak |
| 2 | Moleküler Evrimin hangi buluşlar sayesinde geliştiğini ortaya koymak |
| 3 | Filogenetik ağaçlar oluşturulurken moleküler verilerin kullanılmasını önemi, evrimsel model ve süreçler hakkındaki soruları yanıtlamak için filogenilerin kullanılabileceği çeşitli yolların açıklanması |
| 4 | Genetik varyasyonların kökenini ortaya koymak |
| 5 | Sürüklenme ve seçilimin evrimsel süreçlerinin, moleküler düzeyde nasıl etki ettiğinin araştırılması |
| 6 | Klasik ve Denge Ekolleri ile Yaklaşık Nötal kuramın önemini ortaya koymak |
| 7 | Moleküler saatle ilgili örnekler vermek, moleküler evrim için önemini ortaya koymak |
| 8 | Moleküler düzeyde doğal seleksiyonun örneklerini ortaya koymak |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Evrimsel Biyolojinin temelini oluşturan konuların kısa özeti, Moleküler Evrime Giriş, Filogenetik ağaçlar, Genler, Yapıları fonksiyonları ve Evrimi, Evrim sürecinin modelleri, Nötralist-Seleksiyonist Tartışması, İşlevsel sınırlama ve sübstitüsyon oranı, Baz kompozisyonu ve kodon kullanımının modelleri, Moleküler saat, Yaklaşık Nötral Teori, Tür İçi Genetik Varyasyonun Açıklanması, Moleküler Düzeyde Doğal Seleksiyon
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Evrimsel Biyolojinin temelini oluşturan konuların kısa özeti | ||
| 2 | Moleküler Evrime Giriş | ||
| 3 | Filogenetik ağaçlar: Ağaç terminolojisi; filogeni çıkarımının mantığı; homoloji, homoplazi, atasal özelliklere geriye dönüş kavramlarının açıklamnması; Parsimoni, karakter seçimi; çoklu moleküler karakterlerle parsimoni | ||
| 4 | Genler, Yapıları fonksiyonları ve Evrimi: Kalıtım biçimleri; organel kalıtımı; hayvan mitokondriyal DNA’sı; bitki mitokondriyal DNA’sı; kloroplast DNA’sı;haploid kromozomlar; melezleri tanımlama; uniparental belirleyicilerin sakıncaları | ||
| 5 | Evrim sürecinin modelleri; Populasyon genetiğinin Klasik ve Denge ekolleri; Doğal seleksiyonun bedeli ve nötral kuramınn doğası | ||
| 6 | Nötralist-Seleksiyonist Tartışması | ||
| 7 | İşlevsel sınırlama ve sübstitüsyon oranı (amino asit düzeyinde işlevsel sınırlama, nükleotit düzeyinde işlevsel sınırlama, işlevsel sınırlamadaki değişimler | ||
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | Baz kompozisyonu ve kodon kullanımının modelleri 1: Omurgalı genomlarının izokor yapısı | ||
| 10 | Baz kompozisyonu ve kodon kullanımının modelleri 2: Kodon kullanımını belirleyen nedir | ||
| 11 | Moleküler saat1 : nötral kuram ve moleküler saat; dağılma indeksi | ||
| 12 | Moleküler saat 2 : soy hattı etkileri (nesil süresi, metabolik hız ve DNA tamiri etkinliklerindeki farklar) moleküler saattaki varyasyonu açıklayabilirmi? | ||
| 13 | Yaklaşık Nötral Teori: Yaklaşık nötral teori moleküler saatteki varyasyonu açıklayabilirmi? | ||
| 14 | Tür İçi Genetik Varyasyonun Açıklanması: nötral kuramın tür içinde test edilmesi; seçici süpürme ve birlikte sürüklenme kavramları | ||
| 15 | Moleküler Düzeyde Doğal Seleksiyon: moleküler doğal seleksiyon örnekleri; nispi sinonim olmayan ve sinonim olan sübstitüsyon oranları; elde edilen sonuçlarla nötralist-seleksiyonist tartışmasını çözebilirmi? | ||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
DERS KİTABI: Page, R. D. M., Holmes, E. C., ‘Molecular Evolution A Phylogenetic Approach’.Blackwell Publishing company, 2008. YARDIMCI KİTAPLAR: Freeman, S. Ve Herron, J. C., ‘Evrimsel Analiz’ Çeviri Editörleri: B. Çıplak, H.H. Başıbüyük, S. Karaytuğ, İ. Gündüz. Palme Yayıncılık 2009 Futuyama, D. J., ‘Evrim’ Çeviri Editörleri: A. Kence, A. N. Bozcuk. Palme Yayıncılık 2008
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 1 | 1 |
| Final Sınavı | 1 | 1 | 1 |
| Derse Katılım | 14 | 2 | 28 |
| Rapor Hazırlama | 4 | 2 | 8 |
| Seminer | 1 | 1 | 1 |
| Bireysel Çalışma | 12 | 2 | 24 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 12 | 12 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 14 | 14 |
| Okuma | 12 | 2 | 24 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 113 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 4 | 5 | 3 | 5 | ||||
| ÖÇ 2 | 5 | 5 | 4 | ||||||
| ÖÇ 3 | 4 | 4 | 4 | 3 | |||||
| ÖÇ 4 | 5 | 4 | |||||||
| ÖÇ 5 | 4 | 5 | 4 | 4 | 4 | ||||
| ÖÇ 6 | 5 | 3 | 4 | 5 | |||||
| ÖÇ 7 | 4 | 4 | 5 | 4 | 4 | ||||
| ÖÇ 8 | 5 | 4 | 5 | 4 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek