GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 402053062020 | MİKROBİYAL FİZYOLOJİ | Ders | 3 | 6 | 4,00 |
Dersin Seviyesi
Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Prokaryotlar aerobik ve anaerobik, karanlık ve ışık olan, düşük ve yüksek basınçlı, düşük ve yüksek tuz konsantrasyonlu ve uç asit ve alkali hemen hemen tüm çevrelerde bulunabilirler. Bunun bir sonucu olarak prokaryotik mikroorganizmalar metabolizma ve fizyolojileri bakımından tahmin edilmesi güç çeşitlilik gösterirler. Litotrofi ve azot fiksasyonu gibi bazı fizyolojik tipler sadece prokaryotların bazı gruplarında görülür. Bu dersin amacı ise prokaryotların farklı gruplarındaki metabolik çeşitlilik hakkında genel bir bakış açısı oluşturmaktır
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof. Dr. Güven Özdemir
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Mikrobiyal metabolik çeşitliliğin teori ve uygulamalarında temel kavramları kazanabilme ve gerekli bağlantıları kurabilme |
| 2 | Uygulamalı bilimlerde mikrobiyal metabolik çeşitliliğini önemini kavrayabilme. |
| 3 | Mikrobiyal metabolik çeşitliliğin teori ve uygulamaları endüstriye, tarıma, sağlık ve çevre problemlerine uygulayabilme |
| 4 | Canlılığı tehdit eden koşullarda oluşan mikrobiyal adaptasyonları öğrenebilme |
| 5 | Ülkemiz mikrobiyal biyoçeşitliliğinin korunması ve sürdürülebilmesinin önemini anlamlandırabilme ve değerlendirebilme |
| 6 | Konuyla ilgili güncel yayınları takip edebilme |
| 7 | Mikrobiyal metabolik çeşitlilik hakkında elde ettiği bilgileri sözlü ya da yazılı aktarabilme. |
| 8 | Deneysel mantık, analitik düşünce, nicel analiz ve problem çözümü arasındaki bağlantının kurulmasını sağlayabilme |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Glukozun pürivata oksidasyonu (EMP, PP ve ED yol izleri); prokaryotlarda enerji eldesi; asidofil ve alkalifillerde PMF, anaerobik solunum,(denitrifikasyon, metal indirgenmesi, sülfat indirgenmesi, metan oluşumu, homoasetogenesis,); kemolitotrofi (nitrifikasyon, anammox, hidrojen ve kükürt bileşiklerinin oksidasyonu), anaerobik fotosentez, azot ve sülfat asimilasyon, yüksek sıcaklık, tuz altında yaşayan archael türlerde yaşam stratejileri ve mikrobiyal büyümenin kinetiği
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Laboratuvar | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Bakteriyal fizyoloji ve metabolizmaya giriş: Prokaryotlarda yapı-fonksiyon ilişkisi ve benzersiz metabolik proseslerin önemi | |||
| 2 | Membranda madde taşınımı ve protein salınımı:İyonophorlar,genel salgılama sistemleri ve ABC taşınım yolizi | |||
| 3 | Prokaryotlarda glikolizis çeşitliliği: EMP,PP and ED yol izleri; TCA döngüsü | |||
| 4 | Elektron taşınımı ve oksidatif fosforilasyon: Serbest oluşum enerjisinden ΔG0’,bir oks-red reaksiyonunun serbest enerjisi | |||
| 5 | Biyosentez ve mikrobiyal büyüme:Sülfat asimilasyonu,aminoasit.,nukleotid velipit biyosentezi,sakkarit ve türevlerinin sentezi,hücre bölünmesi ve büyüme verimi. | |||
| 6 | Glukoz dışındaki substratlarda gerçekleşen heterotrofik metebolizma:polimerlerin hidrolizi,organik ve a.a.kullanımı,alifatik ve aromatik bileşiklerin oksidasyonu | |||
| 7 | Öğrenci Sunumları | |||
| 8 | Arasınav | |||
| 9 | Glukoz dışındaki substratlarda gerçekleşen heterotrofik metebolizma:Metan ve metanol kullanımı,tam olmayan oksidasyonlar | |||
| 10 | Anaerobik fermentasyon: Moleküler oksijen ve anaeroblar, etanol, laktat fermentasyonu, bütirat ve aseton-bütanol-etanol karışık asit, bütandiol, propionat fermentasyonu. A.a ve dikarboksilik asitlerin fermentasyonu | |||
| 11 | Anaerobik fermentasyon: Denitrifikasyon, Metal indirgenmesi, sulfidogenesis, metanogenesis, homoacetogenesis, sintrofik ilişkiler, nitrat indirgenmesi. | |||
| 12 | Kemolitotrofi: Nitrifikasyon, sülfür ferro demir ve hidrojen oksidasyonu, kemolitotroflarda CO2 fiksasyonu | |||
| 13 | Prokaryotlarda fotosentez: Fotosentetik mikroorganizmalar, pigmentler ve yapılar, ışık reaksiyonları, fototroflarda karbon metabolizması. | |||
| 14 | Metabolik regülasyon: N2 fiksasyonunun biyokimyası ve regülasyonu, global regülasyon: çevresel strese karşı oluşturulan yanıtlar. | |||
| 15 | Öğrenci Sunumları | |||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
-Madigan, M.T ve Martinko, J.M. “Mikroorganizmaların Biyolojisi” 14th Ed. Çökmüş, C. Çeviri Editörü. Palme Yayıncılık, Ankara, 2017. -Kim, B. H.and Gadd, G.M. “Bacterial Physiology and Metabolism” Cambridge University Press,The Edinburgh Building, Cambridge CB2 8RU, UK, 2008.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 75 |
| Laboratuvar Sınavı | 1 | 25 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 8 | 8 |
| Final Sınavı | 1 | 8 | 8 |
| Derse Katılım | 14 | 2 | 28 |
| Laboratuvar | 14 | 2 | 28 |
| Takım/Grup Çalışması | 3 | 2 | 6 |
| Rapor Hazırlama | 2 | 3 | 6 |
| Rapor Sunma | 2 | 1 | 2 |
| Makale Kritik Etme | 4 | 2 | 8 |
| Bireysel Çalışma | 12 | 2 | 24 |
| Okuma | 12 | 1 | 12 |
| Rapor | 2 | 1 | 2 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 132 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | |
| ÖÇ 1 | 4 | 5 | 5 | 4 | |||||
| ÖÇ 2 | 5 | 4 | 5 | 5 | 3 | 5 | |||
| ÖÇ 3 | 3 | 5 | 4 | 5 | 4 | 5 | |||
| ÖÇ 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | |||||
| ÖÇ 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 4 | ||||
| ÖÇ 6 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||
| ÖÇ 7 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | ||||
| ÖÇ 8 | 5 | 4 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek