GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BİYM406 | MICROBIAL GENETICS | Ders | 4 | 8 | 4,00 |
Dersin Seviyesi
Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
İngilizce
Dersin Amacı
Bu dersin amacı, öğrencilerin mikrobiyal genetiğin temel kavramlarını öğrenmesini, prokaryot ve ökaryot mikroorganizmalardaki gen ifadesinin regülasyonunu, mikroorganizmalardaki mutasyonların ve tamir mekanizmalarının kavranmasını, homolog rekombinasyonun ve bölgeye özgü rekombinasyonların moleküler mekanizmasını ve fonksiyonlarını kavramasını, bakteriyofaj genetiğinin ve moleküler mekanizmaların öğrenilmesini, transformasyon, konjugasyon ve transdüksyon gibi gen aktarım mekanizmalarının moleküler düzeyde öğrenilmesini, mikrobiyal genomiks ve temel genetik mühendisliği yöntemlerinin öğrenilmesini sağlamaktır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof. Dr. Özlem ABACI GÜNYAR
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Mikrobiyal genetikteki temel kavramları ve moleküler mekanizmaları öğrenebilme |
| 2 | Prokaryotik ve Ökaryotik organizmalar arasında moleküler biyolojik açıdan farklılıkları kavrayabilme |
| 3 | Prokaryotik ve Ökaryotik organizmalarda gen anlatımının düzenlenme mekanizmalarını öğrenme |
| 4 | Prokaryotik organizmalarda genetik madde aktarım sistemlerini anlama |
| 5 | Biyolojik bilginin saklanması ve analiz edilmesi aracı olarak omiks teknolojilerini öğrenmek |
| 6 | Ders kapsamında elde edilen bilgilerin biyoteknolojik uygulama alanları hakkında bilgi sahibi olma |
| 7 | Alanda kullanılan temel moleküler metodlar, aletler, cihazların kullanımının kavranması |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Prokaryotlarda gen ifadesinin regülasyonu; DNA’ya bağlanan proteinler, negatif ve pozitif kontrol, aktivatör proteinlerin bağlanması, sinyal iletimi, global regülasyon mekanizmaları, antisens RNA, riboswitch’ler, atenüasyon. RNA splicing ve alternatif splicing moleküler mekanizma ve fonksiyonları. Mikroorganizmalarda mutasyonlar ve tamir mekanizmaları. Mikrooganizmalarda homolog rekombinasyonun moleküler mekanizması ve fonksiyonu. Bakteriyofaj genetiği, faj genomunun topolojisi ve topografisi, komplementasyon, genel genomik yapı ve gen düzenlenmesi, enfeksiyon prosesinin detayları, T4 gen ifadesinin regülasyonu, T4’deki intronlar ve yeni bir gen splicing şekli. Transformasyon. Plasmidler. Konjugasyon. Transdüksyon. Transpozonlar ve diğer hareketli genetik elementler, bölgeye özgü rekombinasyon. Mikrobiyal genomiks. Genetik mühendisliği.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Laboratuvar | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Prokaryotlarda Gen İfadesinin Regülasyonunda özel mekanizmalar; DNA’ya Bağlanan Proteinler, Represyon ve İndüksyon, Pozitif kontrol, Aktivatör Proteinlerin Bağlanması, Sinyal Transdüksyon, Global Regülasyon Mekanizmaları, Antisens RNA, Riboswitch’ler, Atenüasyon. | |||
| 2 | RNA Splicing molekülermekanizması ve fpnksiyonu | |||
| 3 | Alternatif Splicing Moleküler Mekanizma ve fonksiyonları | |||
| 4 | Mikroorganizmalarda mutasyonlar ve tamir mekanizmaları | |||
| 5 | Mikrroganizmalarda homolog rekombinasyonun moleküler mekanizması ve fonksiyonu | |||
| 6 | Bakteriyofaj Genetiği, Faj genomunun topolojisi ve topografisi, komplementasyon, genel genomik yapı ve gen düzenlenmesi, enfeksyon prosesinin detayları, T4 gen ifadesinin regülasyonu, T4’deki intronlar ve yeni bir gen splicing şekli. | |||
| 7 | Transformasyon | |||
| 8 | Arasınav | |||
| 9 | Plasmidler | |||
| 10 | Konjugasyon I | |||
| 11 | Konjugasyon II | |||
| 12 | Transdüksyon | |||
| 13 | Transpozonlar ve diğer hareketli genetik elementler, Site spesifik rekombinasyon | |||
| 14 | Mikrobiyal Genomiks | |||
| 15 | Genetik mühendisliği | |||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
DERS KİTABI: • Snyder, L. and Chapness, L. “Molecular Genetics of Bacteria”. 2nd Ed. ASM pres, Washington D.C. USA. 2003. YARDIMCI KİTAPLAR: • Birge, E. A. “Bacterial and Bacteriophage Genetics” 5th Ed. Springer. USA. 2006 • Streips, U.N. and Yasbin, R.E. “Modern Microbial Genetics” 2nd Ed. Wiley-Liss Inc. New York. USA. 2002 • Madigan, M.T ve Martinko, J.M. “Mikroorganizmaların Biyolojisi” 11th Ed. Çökmüş, C. Çeviri Editörü. Palme Yayıncılık, Ankara, 2010.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 75 |
| Laboratuvar Sınavı | 1 | 25 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 1 | 1 |
| Final Sınavı | 1 | 1 | 1 |
| Derse Katılım | 14 | 2 | 28 |
| Laboratuvar | 14 | 2 | 28 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 2 | 15 | 30 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 2 | 15 | 30 |
| Laboratuvar Ara Sınavı | 1 | 1 | 1 |
| Laboratuvar Sınavı | 1 | 1 | 1 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 120 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | |
| ÖÇ 1 | 5 | ||||||||
| ÖÇ 2 | 3 | 3 | 4 | ||||||
| ÖÇ 3 | 3 | 4 | 4 | ||||||
| ÖÇ 4 | 4 | 4 | 3 | ||||||
| ÖÇ 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | |||||
| ÖÇ 6 | 5 | 5 | 3 | ||||||
| ÖÇ 7 | 5 | 4 | 4 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek