GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BKM2301 | BİYOKİMYA-II | Ders | 3 | 5 | 8,00 |
Dersin Seviyesi
Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Biyokimya; biyolojik bilimlerde yapılan büyük reformların başında yer almaktadır. Bu derste; biyolojik bileşenlerin kimyası, biyolojik fonksiyon ile ilişkilendirilmesi ve organizmada gerçekleşen kimyasal reaksiyonların tümü olarak tanımlanan “metabolizma”, transport sistemleri, gibi konular hakkında bilgi vermek temel amaçtır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof. Dr. Burcu OKUTUCU
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Biyomoleküllerin metabolizması ile ilgili bilgileri kullanabilme |
| 2 | Canlılarda gerçekleşen metabolik yolları ve ilgili enerjetik ilişkileri kavrayabilme |
| 3 | Biyolojik makromoleküllerin sentez ve degradasyonu ile ilgili konuları yorumlayabilme becerisi |
| 4 | Metabolik yolların kontrol mekanizmalarını anlayabilme becerisi |
| 5 | Metabolizma bilgilerini kullanarak hastalıkların nedenleri, mekanizmaları ve etkilerini anlayabilme becerisi |
| 6 | Deney yapma, tasarlama ve yorumlayabilme becerisi |
| 7 | Biyokimyanın 21. yüzyılda günlük hayattaki önemini kavrayabilme |
| 8 | Biyokimyasal çalışmalarda yeniliklere vakıf olabilme ve biyokimyasal problerin çözümünde interdisipliner yaklaşımları kavrayabilme |
| 9 | Yazılı ve sözlü iletişim kurabilme ve teorik ve laboratuar çalışmalarında grup ve bireysel çalışma yapabilme becerisi |
| 10 | Etik ve sosyolojik etik konularında bilinc sahibi olabilme |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Metabolizmaya giriş, protein ve amino asit metabolizması, oksidatif dekarboksilasyon ve sitrat çevrimi, karbohidrat metabolizması; glikoliz, glikoneojenez, pentoz fosfat çevrimi, calvin çevrimi, Glikojen Metabolizması; glikojenesis ve glikojenolizis, lipidlerin kimyası ve metabolizması; yağ asidi oksidasyonu, biyosentezi, membran lipidleri, kolesterol ve sterol metabolizması, oksidatif fosforilasyon ve solunum zinciri, elektron transportu, biyolojik membranlar ve selüler transport, fotosentez.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Laboratuvar | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Metabolizmaya giriş; anabolizma, katabolizma, ara metabolizma, makro metabolizma, metabolik yol tipleri, biyoenerjetik, metabolizmadaki genel kontrol mekanizmaları | Çözelti ve Tamponların Hazırlanması | ||
| 2 | Protein ve amino asit metabolizması: Azot fiksasyonu ve dengesi, proteinlerin sindirimi, absorbsiyonu ve degredasyonu, Genel amino asit reaksiyonları: deaminasyon, transaminasyon, dekarboksilasyon, eliminasyon, üre çevrimi ve amino asitlerin katabolizması | Deney 1 Biyomoleküllerde Sindirim (Protein, Karbohidrat, Yağ) | ||
| 3 | Protein ve amino asit metabolizması: Amino asit biyosentezi, nitrik oksit, poliaminler, kreatin ve kreatinin, biyojen aminler, katekolaminler, nörotransmitterler vb. sentezi, Hem sentezi ve degredasyonu, amino asit metabolizma hastalıkları | Deney 2 Amino Asitlerin Deaminasyonu | ||
| 4 | Oksidatif dekarboksilasyon ve sitrat çevrimi, regülasyonu, glioksilat çevrimi | Deney 3 Piruvatın Oksidatif Dekarboksilasyonu | ||
| 5 | Karbohidrat metabolizması; sindirim/absopsiyon, glikoliz/aerobik/anaerobik), glikoneojenez, regülasyon, Cori çevrimi, fermentasyon | Rehberli Problem Çözümü, Tartışma | ||
| 6 | Karbohidrat metabolizması; Pentoz fosfat yolu: oksidatif ve non-oksidatif reaksiyonlar, regülasyon ve Calvin çevrimi | Deney 4 Glukoz Fermentasyonu (Maya) | ||
| 7 | Glikojen metabolizması: Glikojen yapısı ve fizyolojik önemi, glukoz homeostazı, glikojenez ve glikojenoliz, regülasyon, glikojen depo hastalıkları | Deney 5 Anaerobik Glikoliz | ||
| 8 | Ara sınav | Ara sınav | ||
| 9 | Lipid Metabolism:Lipid kimyası ve isimlendirme, sindirim, absorbsiyon, dağılım, doymuş, doymamış ve dallanmış yağ asitlerinin katabolizması, ketojenez, yağ asidi biyosentezi, regülasyon, diğer lipidlerin sentezi ve lipid depo hastalıkları | Deney 6 Laktat dehidrogenaz ekstraksiyonu ve aktivitesinin belirlenmesi | ||
| 10 | Lipid Metabolism:izoprenoid lipidler, steroidler ve karatenoidler, Kolesterol ve sterol metabolizması ve kontrolü | Deney 7 Glikojenin Sığır Karaciğerinden İzolasyonu, Asidik ve Enzimatik Hidrolizi 1. Hafta; Glikojenin Sığır Karaciğerinden İzolasyonu | ||
| 11 | Biyolojik membranlar ve selüler transport | Deney 7 Glikojenin Sığır Karaciğerinden İzolasyonu, Asidik ve Enzimatik Hidrolizi 2. Hafta; Glikojenin Asidik ve Enzimatik Hidrolizi | ||
| 12 | Elektron transport zinciri, oksidatif fosforilasyon ve fotosentez | Deney 8 Lipoksigenaz Aktivitesinin Ölçülmesi: Araşidonik Asit Metabolizması ve İnflamasyon | ||
| 13 | Metabolizmanın entegrasyonu | Rehberli problem çözümü, Tartışma | ||
| 14 | Rehberli problem çözümü | Rehberli problem çözümü, Tartışma | ||
| 15 | Rehberli problem çözümü | Rehberli problem çözümü, Tartışma | ||
| 16 | Final Sınavı | Final sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
C.K. Mathews, K.E. Van Holde, K. G. Ahern, Biochemistry, Pearson Education, (1999) T.M. Devlin, Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, Wiley, John and Sons, 6th edn. (2006) Newsholme, E. and Leech T, Functional Biochemistry in Health and Disease, Wiley, John and Sons, (2009) Horton R., Principles of Biochemistry, Prentis Hall (2005)
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 75 |
| Laboratuvar | 1 | 25 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Quiz | 11 | 1 | 11 |
| Derse Katılım | 14 | 4 | 56 |
| Laboratuvar | 14 | 3 | 42 |
| Rehberli Problem Çözümü | 4 | 4 | 16 |
| Tartışma | 14 | 2 | 28 |
| Rapor Hazırlama | 11 | 5 | 55 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 10 | 10 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 15 | 15 |
| Okuma | 5 | 3 | 15 |
| Quiz için Bireysel Çalışma | 13 | 2 | 26 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 278 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 5 | 1 | 1 | 1 | 5 | 5 | 5 | 5 | 2 | 4 | 5 | 4 | 1 | 4 |
| ÖÇ 2 | 5 | 1 | 5 | 1 | 4 | 1 | 1 | 1 | 2 | 4 | 1 | 4 | 1 | 4 | 4 |
| ÖÇ 3 | 5 | 1 | 1 | 5 | 5 | 1 | 2 | 1 | 5 | 1 | 4 | 1 | 2 | 5 | 1 |
| ÖÇ 4 | 5 | 4 | 4 | 5 | 2 | 3 | 5 | 5 | 1 | 4 | 2 | 1 | 5 | 1 | 1 |
| ÖÇ 5 | 5 | 5 | 1 | 1 | 5 | 1 | 1 | 2 | 4 | 1 | 1 | 5 | 1 | 1 | 1 |
| ÖÇ 6 | 5 | 1 | 5 | 2 | 1 | 5 | 1 | 4 | 1 | 1 | 5 | 5 | 1 | 1 | 4 |
| ÖÇ 7 | 5 | 4 | 1 | 5 | 3 | 1 | 3 | 1 | 1 | 5 | 1 | 1 | 1 | 4 | 1 |
| ÖÇ 8 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 1 | 4 | 4 | 1 | 1 | 1 | 5 | 1 | 1 |
| ÖÇ 9 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 1 | 5 | 1 | 1 | 4 | 1 |
| ÖÇ 10 | 5 | 3 | 4 | 4 | 1 | 1 | 5 | 2 | 1 | 1 | 1 | 5 | 1 | 1 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek