GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BKM2429 | MOLEKÜLER VE METABOLİK MÜHENDİSLİK | Seçmeli Ders Grubu | 4 | 7 | 4,00 |
Dersin Seviyesi
Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Çeşitli endüstriyel ve medikal uygulamalarda yararlı olabilecek yeni ürünlerin geliştirilmesi amacı ile proteinler, karbohidratlar ve metabolik yolakların mühendisliğine yönelik metodlar hakkında bilgi verilmesidir.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof. Dr. Serap EVRAN
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Protein, karbohidrat ve metabolik mühendislik prensiplerini ve metodlarını öğrenebilme |
| 2 | Genetik modifikasyonlar ile tasarlanan proteinler, karbohidratlar ve metabolik yolaklara ilişkin örnekler hakkında bilgi kazanabilme |
| 3 | Moleküler ve metabolik mühendislik tekniklerini kapsayan temel bir araştırmanın planlanması hakkında bilgi kazanabilme |
| 4 | Moleküler ve metabolik mühendislik ile ilgili bilimsel makalelerdeki bilgiyi yorumlayabilme |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Endüstriyel öneme sahip ürünlerin üretimi için hücre mühendisliği ve metabolik yolakların genetik modifikasyonu. Bilimsel, medikal ve endüstriyel uygulamalarda yeni moleküler araçların geliştirilmesinde protein ve karbohidrat mühendisliğinin kullanımı
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Rasyonel protein tasarımı. Protein mühendisliğinde yönlendirilmiş evrim. Hata-eğilimli PCR ve DNA karıştırma. Kütüphane oluşturma metodları. | ||
| 2 | Protein mühendisliğinde faj gösterim, hücre yüzeyi gösterim, hücresiz gösterim. Doğal olmayan amino asitler ile protein mühendisliği. | ||
| 3 | Antikor yapıları dışındaki proteinlerin kullanılması yoluyla sentetik bağlayıcı proteinlerin tasarlanması ve mühendisliği. Protein tasarımı yoluyla protein etkileşimlerinin değiştirilmesi | ||
| 4 | Protein mühendisliği örnekleri. | ||
| 5 | Oligosakkarid ve polisakkarid sentezi için enzim ve substrat mühendisliği | ||
| 6 | Oligosakkarid ve polisakkarid sentezi için enzim ve substrat mühendisliği | ||
| 7 | Ara sınav | ||
| 8 | Metabolik mühendisliğin temel kavramları. Geri besleme tipi regülasyonun değiştirilmesi. Son ürün birikiminin önlenmesi. Kofaktör mühendisliği | ||
| 9 | Metabolik akış analizi. Metabolik yolakların modellenmesi. Metabolik kontrolün ve metabolik ağların analizi. | ||
| 10 | Metabolizma mühendisliği yoluyla karbohidratların sentezi ve modifikasyonu | ||
| 11 | Bakteri hücrelerinde metabolik mühendislik uygulamaları | ||
| 12 | Maya hücrelerinde metabolik mühendislik uygulamaları | ||
| 13 | Sentetik biyoloji. Sistem biyolojisi. | ||
| 14 | Öğrenci sunumları | ||
| 15 | Öğrenci sunumları | ||
| 16 | Final sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Protein Engineering Techniques Gateways to Synthetic Protein Universe, Poluri, Krishna Mohan, Gulati, Khushboo, 2017, Springer. Protein Engineering and Design, Sheldon J. Park, Jennifer R. Cochran, 2010, CRC Press. Carbohydrate-Modifying Biocatalysts, Peter Grunwald, 2011, Jenny Stanford Publishing. The Metabolic Pathway Engineering Handbook Fundamentals, Christina Smolke, 2010, CRC Press. Systems and Synthetic Metabolic Engineering, Yanfeng Liu Guocheng Du Long Liu, 2020, Academic Press.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 2 | 28 |
| Soru-Yanıt | 14 | 2 | 28 |
| Rapor Sunma | 1 | 2 | 2 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 2 | 28 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 10 | 10 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 120 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 3 | 5 | 3 | 2 | 3 | 2 | 1 | 3 | 1 | 1 |
| ÖÇ 2 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 3 | 3 | 5 | 2 | 3 | 2 | 1 | 3 | 1 | 1 |
| ÖÇ 3 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 3 | 2 | 3 | 4 | 1 | 1 |
| ÖÇ 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 3 | 5 | 4 | 5 | 3 | 5 | 1 | 1 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek