GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9301195142010 | Biyoinformatik | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 7,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Dersin amacı Biyoistatistik ve Medikal İnformatik Yüksek Lisans öğrencilerine informatik uygulamaların moleküler biyoloji boyutu ile ilgili teorik ve pratik kavramları aktarmaktır. Bu ders ile öğrencilerin veri bankalarındaki çok miktardaki verilerin analizlerine yaklaşımlar sağlamaları amaçlanmıştır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof. Dr. Kemal Sami KORKMAZ
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Biyoinformatiğin biyolojideki yeri ve önemi bilme ve kavrama |
| 2 | hücreler ve Çoklu veri üreten sistemleri tanıma |
| 3 | veri çeşitleri ve analizlerini bilme |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
• Temel biyolojik kavramlar • Biyoinformatiğin biyolojideki yeri ve önemi • Biyoinformatik veribankaları, deposituvarlar (NCBI, EMBL, Refseq, Genbank, PDB, SwissProt) • Biyolojik veriler (örneğin; insan genomu, protein yapıları) ve bu verilerin yaşam bilimciler tarafından nasıl kullanıldığı • Hücreler kullanılarak çoklu veri üreten sistemler • Veri çeşitleri ve analizi
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | • Temel biyolojik kavramlar | ||
| 2 | • Temel biyolojik kavramlar | ||
| 3 | • Biyoinformatiğin biyolojideki yeri ve önemi | ||
| 4 | • Biyoinformatiğin biyolojideki yeri ve önemi | ||
| 5 | • Biyoinformatik veribankaları, deposituvarlar (NCBI, EMBL, Refseq, Genbank, PDB, SwissProt) | ||
| 6 | • Biyoinformatik veribankaları, deposituvarlar (NCBI, EMBL, Refseq, Genbank, PDB, SwissProt) | ||
| 7 | • Biyoinformatik veribankaları, deposituvarlar (NCBI, EMBL, Refseq, Genbank, PDB, SwissProt) | ||
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | • Biyolojik veriler (örneğin; insan genomu, protein yapıları) ve bu verilerin yaşam bilimciler tarafından nasıl kullanıldığı | ||
| 10 | • Biyolojik veriler (örneğin; insan genomu, protein yapıları) ve bu verilerin yaşam bilimciler tarafından nasıl kullanıldığı | ||
| 11 | • Hücreler kullanılarak çoklu veri üreten sistemler | ||
| 12 | • Hücreler kullanılarak çoklu veri üreten sistemler | ||
| 13 | • Veri çeşitleri ve analizi | ||
| 14 | • Veri çeşitleri ve analizi | ||
| 15 | • Veri çeşitleri ve analizi | ||
| 16 | Final |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
NCBI database site http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gquery/gquery.fcgi PDB database site http://www.rcsb.org/pdb/
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir.
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 2 | 28 |
| Uygulama/Pratik | 14 | 1 | 14 |
| Ödev Problemleri için Bireysel Çalışma | 5 | 6 | 30 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 10 | 10 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 10 | 10 |
| Okuma | 8 | 4 | 32 |
| Ev Ödevi | 5 | 6 | 30 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 158 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | |
| ÖÇ 1 | 4 | 5 | 4 | |||
| ÖÇ 2 | 4 | 4 | ||||
| ÖÇ 3 | 5 | 5 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek