GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9101025022004 | Bitkilerde Sinyal Geçirim Yolları | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 8,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu dersin amacı; öğrencilerin, bitkilerin çevrelerindeki değişken koşullara adapte olabilmelerini sağlayan temel sinyal iletim yollarını öğrenmeleri, bu sinyal iletim yollarının işleyişlerindeki mekanizmaları anlamalarını ve bu konuda literatürdeki güncel gelişmeleri takip etmelerini sağlamaktır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof.Dr. İsmail TÜRKAN
Öğrenme Çıktıları
| 1 | 7.Sinyal iletiminin moleküler mekanizmalarını kavrayabilme. |
| 2 | 9.Ders hakkında güncel yayınları takip ederek yeni gelişmelerin öğrenilmesi, sunulması ve ders içinde tartışılması yoluyla öğrenciyi araştırmaya yöneltebilme. |
| 3 | 10.Sinyal iletim yollarının öğrenilmesi ve modifikasyonu ile tarımsal üretimin biyoteknolojik yaklaşımlarla iyileştirilebileceğini gösterrebilme. |
| 4 | 8.Öğrencinin bu dersten edindiği bilgilerle, kompleks sinyal iletim mekanizmalarını daha kolay anlayabilmesini sağlama. |
| 5 | 6.Bitkilerde sinyal iletiminde rol alan protein modifikasyonlarını öğrenebilme. |
| 6 | 1.Bitkiler ve çevreleri arasındaki etkileşimi kavrayabilme. |
| 7 | 3.Bitkilerdeki temel sinyal iletim yollarını detaylı olarak öğrenebilme. |
| 8 | 4.Bitkilerde sinyal iletim yollarında görev alan önemli gen aileleri, ve protein çeşitlerini öğrenebilme. |
| 9 | 2.Sinyal iletim yollarının çalışma prensipleri hakkında genel bilgi edinebilme. |
| 10 | 5.Sinyal iletiminde gen ifadesi düzenlenmesini öğrenebilme. |
Öğretim Sistemi
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Bitkiler ve çevre arasında etkileşim, Işığın algılanması ve sinyal iletimi, Yaralanma ve mekanik etkilerde sinyal iletimi, Bitki sinyal iletim yollarında aktif oksijen türlerinin rolü, Sıcaklık stresi ile indüklenen sinyal iletim yolları, Soğuk stresinde sinyal iletiminin moleküler mekanizmaları, Kuraklık stresi sırasında sinyal iletim yolları, Tuz stresin sırasında sinyal iletim yolları, Bitkilerin bakteri ve fungusları tanımalarında ve korunmalarında görev alan sinyal iletim yolları, Bitki-virüs etkileşiminde sinyal iletim yolları, Bitki-böcek etkileşiminde sinyal iletim yolları, Ektomikorizal simbiyozda rizosferik sinyaller.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Derse giriş; bitkiler ve çevre arasında etkileşim | ||
| 2 | Işığın algılanması ve sinyal iletimi: • Kriptokrom (CRY) ve fitokrom (PHY) fotoreseptör aileleri • Fotoreseptör mutantları ve yüksek ifade çalışmaları • Işık tarafından uyarılan sinyal mekanizmalarının aydınlatılması için biyokimyasal yaklaşımlar • Sinyal iletiminin genetik analizi • Hücre biyolojisi yaklaşımları | ||
| 3 | Yaralanma ve mekanik etkilerde sinyal iletimi: • Yağ asidi, peptit ve oligosakkarit sinyalleri • Yaralanma ve herbivor saldırıları • Mekanik uyarılarda sinyal iletimi | ||
| 4 | Bitki sinyal iletim yollarında aktif oksijen türlerinin rolü: • Bitkilerde aktif oksijen türleri • Sinyal molekülleri olarak aktif oksijen türleri • Sinyal iletimin ağının bir parçası olarak aktif oksijen türleri | ||
| 5 | Sıcaklık stresi ile indüklenen sinyal iletim yolları: • Membranlar, kalsiyum ve protein kinaz kaskadları ile çalışan sinyal sistemleri • Isı şoku faktörü sinyal ağı • Sıcaklık stresi tarafından etkilenen kompleks hücre cevapları | ||
| 6 | Soğuk stresinde sinyal iletiminin moleküler mekanizmaları: • Düşük sıcaklığa alışma cevapları • Düşük sıcaklığın algılanması • Düşük sıcaklıkta sinyal iletimi | ||
| 7 | Konu hakkında bilimsel yayın sunumu ve tartışma | ||
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | Kuraklık stresi sırasında sinyal iletim yolları: • Kuraklık stresinin algılanması • Sinyal iletiminde ABA’nın rolü: ABA bağımlı ve ABA bağımsız sinyal yolları • Sinyal yollarının aydınlatılması için mutantların kullanımı • Kuraklık stresinde sinyal iletiminde rol alan önemli transkripsiyon faktörleri • Stres toleransının arttırılması için kuraklık stresinde çalışan sinyal iletim yollarının kullanılması | ||
| 10 | Tuz stresin sırasında sinyal iletim yolları: • Bitkilerde tuza toleransı belirleyen özellikler • Bitkiye tuz alınımı • Tuza tolerans cevaplarının düzenlenmesi • Tuza toleransta görev alan sinyal iletim yolları | ||
| 11 | Bitkilerin bakteri ve fungusları tanımalarında ve korunmalarında görev alan sinyal iletim yolları: • Patojenin algılanması ve sinyal iletiminin başlatılması • Bitki savunmasında sinyal iletim yolları • Savunmada iş gören sinyal iletim yollarının uygulamada kullanımı | ||
| 12 | Bitki-virüs etkileşiminde sinyal iletim yolları: • Viral replikasyon için konuk DNA sentez mekanizmalarının uyarılması • Post-transkripsiyonel gen splaysinginin viral olarak baskılanması • Virus infeksiyonu sürecinde konuk bitkinin gen ifadesindeki değişiklikler • R-geni ile sağlanan savunma cevaplarının uyarılması | ||
| 13 | Bitki-böcek etkileşiminde sinyal iletim yolları: • Direk savunmanın uyarılması; proteinase inhibitörleri, sekonder metabolitler • Dolaylı savunmanın uyarılması; uçucu bileşikler | ||
| 14 | Ektomikorizal simbiyozda rizosferik sinyaller: • Ektomikorizal gelişme • Mikoriza gelişiminde gen ifadesinin belirlenmesi ve analizi | ||
| 15 | Konu hakkında bilimsel yayın sunumu ve tartışma | ||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
DERS KİTABI: Scheel D., Wasternack C., Plant Signal Transduction.,Oxford Univerty Press, New York, 2002. YARDIMCI KİTAPLAR: Taiz L., Zeiger E. Plant Physiology, Sinauer Press, 2006.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir.
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 3 | 3 |
| Final Sınavı | 1 | 4 | 4 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Seminer | 2 | 8 | 16 |
| Bireysel Çalışma | 2 | 35 | 70 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 22 | 22 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 2 | 22 | 44 |
| Okuma | 13 | 3 | 39 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 240 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | |||||||
| ÖÇ 2 | |||||||
| ÖÇ 3 | |||||||
| ÖÇ 4 | |||||||
| ÖÇ 5 | |||||||
| ÖÇ 6 | |||||||
| ÖÇ 7 | |||||||
| ÖÇ 8 | |||||||
| ÖÇ 9 | |||||||
| ÖÇ 10 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek