GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9101025392007 | Bakteriyal Tanı ve Tiplendirmede Moleküler Yöntemler | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 1 | 8,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Dersin amacı, öğrencilere bakteri tanılaması ve tiplendirilmesinde kullanılan moleküler yöntemlerin ve uygulama alanlarının öğretilmesidir.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Associate Professor Ataç UZEL
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Bakteriler arasındaki filogenetik ilişkilerin kavranabilmesi için kullanılan moleküler yöntemleri kavrayabilme. |
| 2 | Tanılamada kullanılan altın standartların öğrenilebilmesi. |
| 3 | Prokaryotik tür kavramını öğrenebilme. |
| 4 | Bakterilerin tanılanmasında kullanılan moleküler yöntemlerin karşılaştırmalı olarak öğrenilebilmesi. |
| 5 | Bakteriyal tiplendirmenin ve tiplendirme yöntemlerinin öğrenilmesi. |
| 6 | Bakteriyal tanı ve tiplendirmenin klinik ve çevresel mikrobiyolojideki uygulamalarının öğrenilmesi. |
Öğretim Sistemi
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Bakteriyel tür kavramı; Bakteriyel filogenetik ilişkiler; Mikrobiyal kaynak merkezleri; İdentifikasyonun önemi, Kültüre edilemeyen organizmalar ve İdentifikasyon; Genotipik karakterizasyon yöntemleri, Avantaj ve Dezavantajlar; İdentifikasyonda altın standart. Tiplendirme yöntemleri ve uygulamaları.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Prokaryotik tür kavramı | ||
| 2 | Tür sınırlarını tanımlamada kullanılan kriterler | ||
| 3 | Fluoresan İn-Situ Hibridizasyon ve Tanısal Mikrobiyolojideki Uygulamaları | ||
| 4 | DNA Probları | ||
| 5 | In Vıtro Nükleik Asit Amplifikasyon Teknikleri | ||
| 6 | Nükleik Asit Ve Sinyal Amplifikasyon Teknikleri | ||
| 7 | Real Time PCR ve uygulamaları | ||
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | Amplifiye Ribozomal DNA Restriksyon Analizi (ARDRA), Sıngle-Strand Conformatıonal Polymorphısm Analysıs (SSCP) | ||
| 10 | Multilokus sekans tiplendirmesi, Multilokus Enzim Elektroforezi | ||
| 11 | Temperature ve Denaturing Gradient Gel Electrophoresis, Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism Analizi | ||
| 12 | Rep-PCR Genomik Fingerprinting, Amplified Fragment Length Polimorphism | ||
| 13 | Otomatize Ribotiplendirme, Plazmid Temelli Tiplendirme Teknikleri | ||
| 14 | Variable Number Tandem Repeats, Viral Tiplendirme için DNA Dizi analizi | ||
| 15 | Pulse Field Gel Elektroforzi (PFGE), Arbitrarily Primed PCR | ||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
DERS KİTABI: 1. Moleküler Mikrobiyoloji, Tanı Prensipleri ve Uygulamalar, Persing, D.H., et al., Palme Yayıncılık, 2006 YARDIMCI KİTAPLAR: 1- K.J. Towner and A. Cockayne (Editors), (1993) Molecular Methods for Microbial Identification and Typing 200p. Springer; 1st edition, London, UK 2- F.G. Priest and M. Goodfellow (Editors), (2006) Applied Microbial Systematics, 500p. Kluwer Academic Publitions, Netherlands.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir.
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Rapor Hazırlama | 4 | 8 | 32 |
| Rapor Sunma | 4 | 3 | 12 |
| Seminer | 2 | 4 | 8 |
| Makale Kritik Etme | 7 | 1 | 7 |
| Bireysel Çalışma | 10 | 2 | 20 |
| Ödev Problemleri için Bireysel Çalışma | 7 | 3 | 21 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Okuma | 14 | 4 | 56 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 242 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | |||||||
| ÖÇ 2 | |||||||
| ÖÇ 3 | |||||||
| ÖÇ 4 | |||||||
| ÖÇ 5 | |||||||
| ÖÇ 6 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek