GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9101025932010 | Mikrobiyolojide Real Time PCR | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 1 | 10,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Dersler sonunda öğrencilerin Real Time PCR ve onun mikrobiyolojide kullanımı hakkında bilgi sahibi olmaları amaçlanmaktadır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof.Dr. Güven Özdemir
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Dersler sonunda öğrencilerin Real Time PCR hakkında bilgi sahibi olabilmeleri |
| 2 | Real Time PCR'ın mikrobiyolojide kullanımı hakkında bilgi sahibi olabilmeleri |
| 3 | SYBR Green vb boyaların çalışma prensiplerini öğrenebilme |
| 4 | Prob temelli sistemlerin çalışma prensiplerini öğrenebilme |
Öğretim Sistemi
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Öğrencilerin temel moleküler biyoloji alt yapısının olması istenir
Dersin İçeriği
Real Time PCR tarihçe ve florojenik kimya (SYBR Green ve Prob sistemleri). Standartlar, kontroller ve standart eğri hazırlama. Mikroorganizmaların miktarının belirlenmesi. Mikrobiyojide multipleks PCR. Rutin mikrobiyolojik tanıda Real Time PCR’ın rolü. Gen ifadesinin ölçümü. Real Time PCR kullanırken karşılaşılabilecek sorunlar ve çözüm yolları.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Uygulama | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|---|
| 1 | PCR nedir? PCR çeşitleri | |||
| 2 | Real Time PCR nedir? Avantajları Dezavantajları | |||
| 3 | Fluorogenic chemistry | |||
| 4 | Özgül olmayan Belirleme Sistemleri | |||
| 5 | Özgül Belirleme Sistemleri (Hidroliz Probları) | |||
| 6 | Özgül Belirleme Sistemleri (Hibridizasyon Probları) | |||
| 7 | Diğer Özgül Belirleme Sistemleri | |||
| 8 | Arasınav | |||
| 9 | Amplifikasyon eğrileri ve Erime Eğrisi Nedir? | |||
| 10 | Real Time PCR sonuçları nasıl analiz edilir ve değerlendirilir? | |||
| 11 | Standart Eğri | |||
| 12 | QPCR | |||
| 13 | HRM analizleri | |||
| 14 | Multipleks QPCR | |||
| 15 | Delta delta CT yöntemi | |||
| 16 | Final |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Mackay, I. M.., 2007. “Real-Time PCR in Microbiology”. Caister Academic Press, Norfolk, UK. Dorak M.T., 2006 “Real-Time PCR” Taylor ve Francis Group, Newcastle-upon-Tyne, UK
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir.
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Laboratuvar | 14 | 2 | 28 |
| Takım/Grup Çalışması | 4 | 4 | 16 |
| Rapor Hazırlama | 2 | 10 | 20 |
| Rapor Sunma | 1 | 3 | 3 |
| Bireysel Çalışma | 15 | 3 | 45 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 2 | 10 | 20 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 2 | 15 | 30 |
| Okuma | 10 | 2 | 20 |
| Rapor | 2 | 3 | 6 |
| Laboratuvar Ara Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Laboratuvar Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 238 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 0 | 3 | 4 | 4 | 3 | 4 | 5 | 3 |
| ÖÇ 2 | 3 | 3 | 1 | 4 | 3 | 4 | 3 |
| ÖÇ 3 | 4 | 4 | 3 | 5 | 5 | 5 | 4 |
| ÖÇ 4 | 4 | 4 | 3 | 5 | 5 | 5 | 4 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek