GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9101025942010 | Metagenomiks | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 8,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Metagenomiks doğası gereği moleküler biyoloji, mikrobiyoloji, ekoloji, kimya, biyoinformatik, ve tıbbın kesiştiği noktada bulunan kompleks bir alandır. Bu dersin amacı öğrencilere metagenomik verilerin nasıl elde edildiğinin ve bu verilerin çeşitli alanlarda nasıl kullanıldığının öğretilmesidir.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof. Dr. Ataç UZEL
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Metagenomikte kullanılan temel yöntemlerin öğrenilmesi. |
| 2 | Metagenomiğin kullanıldığı temel bilim disiplinlerinin öğrenilmesi. |
| 3 | Metagenomiğin kullanıldığı uygulamalı bilim disiplinlerinin öğrenilmesi. |
| 4 | Mikroroganizmalar arasındaki etkileşimlerin metagenomiks yöntemleri ile öğrenilmesi. |
| 5 | Mikroroganizmalar ile bitkiler, hayvanlar ve insanlar arasındaki etkileşimlerin metagenomiks yöntemleri ile öğrenilmesi. |
| 6 | Metagenomiks ile endüstriyel ürünler elde edilmesinin öğrenilmesi |
Öğretim Sistemi
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
[Yok]
Dersin İçeriği
Metagenomiks ve ekosistem biyolojisi, mikrobiyal komünitelerin metagenomikle tanımlanması, metagenomik veri tabanları, çeşitli canlı grupları arasındaki etkileşimin metagenomik ile saptanması, metagenomiğin biyoteknolojideki kullanım alanları, metagenomiks ile yeni gen keşfi.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Metagenomiks ve ekosistem biyolojisi: Kavramsal çerçeveler, araç ve yöntemler. | ||
| 2 | Metagenomiğin ötesi: Mikrobiyal komünitelerin çalışılmasında tamamlayıcı yaklaşımların birleştirilmesi | ||
| 3 | Prokaryotik mikrobiyal komünitelerde horizontal gen transferi | ||
| 4 | Kompleks mikrobiyal komünitelerin metagenomik tarama ile analizi | ||
| 5 | Dünya çapında metagenomik veri altyapısının kurulması için açık veri kaynakları | ||
| 6 | Bitki-mikrop etkileşimlerinin metagenomik metotlarla araştırılma potansiyeli | ||
| 7 | Metagenomiksin biyoremediasyona uygulanması | ||
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | Endüstriyel Biyoürünler için metagenomiks uygulamaları I | ||
| 10 | Endüstriyel Biyoürünler için metagenomiks uygulamaları II | ||
| 11 | Archeal metagenomiks: Yeni genlerin biyolojik araştırılması | ||
| 12 | Archeal metagenomiks: Yeni kavramların keşfi | ||
| 13 | Metagenomiks ve insan mikrobiyomu çalışmalarındaki uygulamaları I | ||
| 14 | Metagenomiks ve insan mikrobiyomu çalışmalarındaki uygulamaları II | ||
| 15 | Metagenomiksdeki felsefi temalar | ||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
-Metagenomics, Theory, Methods and Applications, Edited by Diana Marco, 212p, Caister Academic Press, Norfolk, UK, 2010. -The New Science of Metagenomics: Revealing the Secrets of Our Microbial Planet. Committee on Metagenomics: Challenges and Functional Applications, 170p, National Research Council, The National Academies Press, Washington D.C. 2007.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir.
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Rapor Hazırlama | 2 | 8 | 16 |
| Rapor Sunma | 2 | 1 | 2 |
| Proje Hazırlama | 2 | 8 | 16 |
| Makale Kritik Etme | 4 | 4 | 16 |
| Bireysel Çalışma | 4 | 4 | 16 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 24 | 24 |
| Okuma | 11 | 4 | 44 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 196 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | |||
| ÖÇ 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | ||
| ÖÇ 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | ||
| ÖÇ 3 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | ||
| ÖÇ 4 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| ÖÇ 5 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek