GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9101027162016 | İleri Sentetik Biyoloji | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 8,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu dersin amacı Sentetik biyolojiyi önemli bir disiplinlerarası bilim olmasına neden olan teorilerin bir kısmını ögrencilere aktarmaktır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof.Dr. İhsan YAŞA
Öğrenme Çıktıları
| 1 | 1. Doğal sistemlerin hızlı ve daha güvenilir programlanmasını sağlayan veya inhibe eden biyoteknolojik özellikleri tanımlayabilmek |
| 2 | 2. Sentetik biyolojiyi önemli bir disiplinlerarası bilim olmasına yardım eden teorilerin bazılarını ögrencilere aktarmak |
| 3 | 3. Yeni ve hızlı gelişen sentetik biyolojideki değişik alanları öğrenmek |
| 4 | 4. Yaşamı Matematik, Bilgisayar, biyoloji ve mühendislik ile anlayabilecek yaklaşımlar oluşturmak |
| 5 | 5. Biyolojik prensip ve özellikleri deneysel olarak keşfetmek |
| 6 | 6.Bu alandaki yayınlanmış en son literatürleri ve sürdürülen araştırmalar hakkında bilgi sahibi olmak |
| 7 | Sentetik biyoloji hakkında bilimsel yayınları takip edebilmek ve anlamak ve değerlendirebilmek |
| 8 | Tez hazırlama,araştırma projesi hazırlama gibi konularda bilgi kazanma ve prokaryotlardan elde edilen sonuçları değerlendirmek |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Modifiye genom, protein ve yolizlerinin yeniden dizaynı, metabolik mühendisliği ve hücre programlı teropatiklerden sentetik biyolojinin aracılığı ile yararlanılabilmektedir ve bu gelişmeler bir çok temel konunun ana çıkış noktası oluşturmaktadır. Sentetik biyoloji sağlam bir mühendislik disipline evrildiğinde, bu biyoteknoloji, ilaç ve kimyasal endüstrileri dönüştürebilecektir. Nükleik asit alternativlerinin araştırılması, Peptid Nükleik asitler (PNA's), Sentetik Yaşamın Temeli Olarak Sentetik Genetik Kodlar, Nükleik Asitlerin Kimyasal Çeşitlendirmesi ile GMOs, Sentetik Biyoloji ile Biyoyakıt Biyoproseslerinin Geliştirilmesi, Sentetik mRNA ile Hücre Mühendisliği, Bacteriyal Adaptif İmmun Sistem ve Sentetik Biyolojide Etik.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Sentetik biyoloji nedir? | ||
| 2 | Nükleik asit alternatiflerinin araştırılması | ||
| 3 | Peptit nükleik asitler | ||
| 4 | Sentetik yaşamın kodları olarak sentetik genetik kodlar | ||
| 5 | Minimal genom | ||
| 6 | Nükleik asitlerin kimyasal çeşitlendirmesi aracılığı ile oluşturulan GDO lar | ||
| 7 | Sentetik fotosentez | ||
| 8 | Ara sınav | ||
| 9 | Aşı olarak sentetik peptitler | ||
| 10 | Viral enfeksiyonların tanısında sentetik peptidler | ||
| 11 | Biyoyakıt üretiminde sentetik biyolojik yaklaşımlar | ||
| 12 | Sentetik mRNA ile Hücre mühendisliği | ||
| 13 | Bakteriyal immun sistem aracılı sentetik biyoloji uygulamaları | ||
| 14 | Sentetic biyolojide etik | ||
| 15 | Sentetik biyolojide son gelişmeler | ||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Ders Kitabı 1. LuisiP.L., and Cristiano Chiarabelli, C.,2011. Chemical Synthetic Biology, First Edition,. John Wiley & Sons, Ltd. ISBN: 978-0-470-71397-6 Yardımcı Kaynaklar 2. Van Regenmortel,M. H. V. and Muller, S.1999 . Synthetıc Peptıdes As Antıgens. ELSEVIER ISBN: 0-444-82175-9 3. Porcar, M.,Peretó, J.,2014.Synthetic Biology:From iGEM to the Artificial Cell. SpringerBriefs in Biochemistry and Molecular Biology ISSN 2211-9361. 4. Clay, S. C. and Fong, S.S. Developing Biofuel Bioprocesses Using Systems and Synthetic Biology.SpringerBriefs in Systems Biology. ISSN 2193-4746.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 60 |
| Rapor Sunma | 1 | 10 |
| Proje Sunma | 1 | 10 |
| Sözlü Sınav | 1 | 20 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Tartışma | 5 | 5 | 25 |
| Beyin Fırtınası | 4 | 4 | 16 |
| Rapor Hazırlama | 7 | 5 | 35 |
| Rapor Sunma | 2 | 8 | 16 |
| Proje Hazırlama | 2 | 4 | 8 |
| Makale Kritik Etme | 4 | 4 | 16 |
| Bireysel Çalışma | 6 | 4 | 24 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 11 | 11 |
| Okuma | 13 | 3 | 39 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 232 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | 4 | 5 | 3 | 1 | 5 | 2 | |
| ÖÇ 2 | 1 | 3 | 5 | 4 | 4 | 5 | |
| ÖÇ 3 | 1 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | |
| ÖÇ 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 3 | 4 | 4 |
| ÖÇ 5 | 1 | 5 | 4 | 3 | 3 | 3 | 5 |
| ÖÇ 6 | 5 | 3 | 4 | 4 | 4 | ||
| ÖÇ 7 | 4 | 5 | 4 | 5 | 4 | 3 | |
| ÖÇ 8 | 4 | 3 | 4 | 5 | 2 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek