GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9101025642022 | Mikrobiyal Biyokütle ve Aktivite Ölçümleri İçin Yöntemler | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 8,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu dersin amacı öğrencilere fungal ve bakteriyal biyokütlenin, fonksiyonel ve enzim aktivitelerinin hesaplanmasını, her iki mikrobiyal grup için özel kimyasal bileşenlerin ölçümlerinin yapılmasını ve bu yöntemlerin biyotransformasyon, bioremediasyon ve zıraai uygulamalardaki kullanılabilirlikleri ve avantajları anlatmaktır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof Dr İhsan YAŞA
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Öğrencilere fungal ve bakteriyal biyokütlenin, fonksiyonel ve enzim aktivitelerinin hesaplanmasını öğretme |
| 2 | Bakteri ve funguslar için özel kimyasal bileşenlerin ölçümlerini yapabilmek |
| 3 | Bu yöntemlerin biyotransformasyon, bioremediasyon ve zıraai uygulamalardaki kullanılabilirlikleri ve avantajları değerlendirebilmek |
| 4 | Disiplinler arası çalışmalara katılabilme |
| 5 | Biyoloji anında bilime yenilik getiren, yeni bir bilimsel yöntem geliştiren ya da bilinen bir yöntemi, bir alana uygulayan özgün bir çalışma yapabilme |
| 6 | Biyoloji alanında bilimsel literatüre katkı sağlamak amacıyla ulusal ya da uluslar arası bir makale hazırlayabilme |
| 7 | Biyoloji alanındaki uygulamalarda, evrensel ve toplumsal değerlere duyarlı, ülke çıkarlarını gözeten, araştıran, üreten, etik ve sorumluluk sahibi bireyler olabilme |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Solunuma dayalı tekniklerle mikrobiyal kütlenin belirlenmesi, funguslara özel kimyasal bileşikler: ergesterol,kitin,fosfolipid yağ esterleri,topraktaki DNA miktarının belirlenmesi ve ekstraksiyon ile bakteri sayımı,mikrobiyal biyokütleyi hesaplanmasındaki enzim ölçümleri.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Toprak ve çevrede mikroorganizmaların sayımı için temel yöntemler | ||
| 2 | Toprak mikrobiyal biyomasının hesaplanması (FDA aktif fungal hifler) | ||
| 3 | Fumigasyon-ekstraksiyon ile mikrobiyal biyomasın hesaplanması | ||
| 4 | Toprak solunumu,Substratla indüklenmiş solunum | ||
| 5 | Mikrobiyal hücrelerin biohacminin belirlenmesi ve sayımı | ||
| 6 | Toprak mikrobiyal aktivitesinin ölçümleri (DMSO indirgenmesi) | ||
| 7 | Sunum | ||
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | Topraktaki azot mineralizasyonu (Selektif-SIR metodu) | ||
| 10 | Bakteriyal büyüme oranının belirlenmesinde timidin lösin katılımı ve toprakta nitrifikasyon , DHA aktivitesi (TTC metot) | ||
| 11 | Enzim aktivite profilleri ve toprak kalitesi (DHA aktivitesi , INT metodu) | ||
| 12 | PLFA analizleri (Posfataz aktivitesi) | ||
| 13 | Substrat utilization in Biolog Plates for analysis of CLPP (Β-glucosidase activity) Β-glukosidaz aktivitesi | ||
| 14 | Topraklarda anaerobik mikrobiyal aktiviteleri (Arilsulfataz aktivitesi) | ||
| 15 | Bakteri-virus etkileşimleri ve ekosistem üzerine etkileri | ||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
DERS KİTAPLARI: Blooem,J.,Hopkins,D.W.,Benedetti,A.”Microbiological Methods For Assessing Soil Quality” CAB International 2006. Taylor, J.P.“Comparation of Microbial Number And Enzymatic Activities In Surface Soils”, Soil Biol. Biochem. Vol 34:387-401,2002 Alef, K., and Nannipieri,P., “ Methods İn Applied Soil Microbiology and Biochemistry ”Academic Press 1995. YARDIMCI KAYNAKLAR : Sylvia,D.M., Fuhrmann J.,J., Hartel, P.G.,Zuberer, D.,A.“Principles And Applications Of Soil Microbiology“ Prentice Hall, New Jersey, 1998. Barajas-Aceves, M., Hassan,M., Tinicp, R., Vazquez-Duhalt,R. “Effect of Pollutants on Ergesterol Content as Indicators of Fungal Biomass. Soil Biol. Biochem. Vol:50, 227-236,2002. West, A.W.,” Improvement of the Selective Respiratory Inhibition Tecnique to Measure Eukaryote:Prokaryote Ratios in Soil, J. Microbiologycal Methods.Vol:5,125-138,1986.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Problem Çözümü | 5 | 6 | 30 |
| Tartışma | 7 | 5 | 35 |
| Takım/Grup Çalışması | 3 | 3 | 9 |
| Deney | 2 | 6 | 12 |
| Rapor Hazırlama | 5 | 5 | 25 |
| Rapor Sunma | 2 | 7 | 14 |
| Makale Kritik Etme | 5 | 6 | 30 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 2 | 28 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 12 | 12 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 241 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | 3 | 4 | 3 | 3 | |||
| ÖÇ 2 | 4 | 5 | 4 | ||||
| ÖÇ 3 | 3 | 5 | 3 | 5 | |||
| ÖÇ 4 | 4 | 2 | |||||
| ÖÇ 5 | 5 | 5 | 4 | 4 | 2 | ||
| ÖÇ 6 | 4 | 5 | 2 | 3 | 3 | ||
| ÖÇ 7 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek