GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9101025092023 | İmmünoinformatik | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 1 | 8,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
İmmünoinformatik dersi biyoteknolojik aşıların geliştirilmesi sırasında gerekli olan antijen ve epitop keşfini mümkün kılan programların teorik anlatımını, kullanımını ve elde edilen sonuçların yorumlanarak en doğru antijen ve epitop keşfinin bilgisayar ortamında yapılmasını amaçlamaktadır. Dahası elde edilen veriler ile peptit tabanlı bir aşı tasarımı uygulamasını da amaçlamaktadır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Doç. Dr. Hüseyin CAN
Öğrenme Çıktıları
| 1 | İmmünoinformatik yaklaşım |
| 2 | B ve T hücre reseptörleri |
| 3 | Antijen sunumu mekanizmaları |
| 4 | Antijen keşfi |
| 5 | Epitop keşfi |
| 6 | Protein-protein etkileşimi analizleri |
| 7 | Peptit aşı tasarımı konularında bilgi sahibi olunacaktır. |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
[Yok]
Dersin İçeriği
İmmünoinformatiğe giriş, B ve T hücre reseptörleri, antijen sunumu mekanizmaları, veri bankalarının tanıtımı, antijen keşfi, B hücre epitop keşfi, MHC-I epitop keşfi, MHC-II epitop keşfi, Docking analizi konuları yanında elde edilen veriler ile peptit tabanlı bir multi epitop aşı tasarımı uygulaması gerçekleştirilecektir.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Uygulama | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|---|
| 1 | İmmünoinformatiğe giriş | |||
| 2 | B ve T hücre reseptörleri | |||
| 3 | Antijen sunumu mekanizmaları | |||
| 4 | DNA ve Protein veri tabanları | |||
| 5 | Antijen keşfi | |||
| 6 | B hücre epitop keşfi-1 | |||
| 7 | B hücre epitop keşfi-2 | |||
| 8 | Ara Sınav | |||
| 9 | MHC-I epitop keşfi -1 | |||
| 10 | MHC-I epitop keşfi-2 | |||
| 11 | MHC-II epitop keşfi -1 | |||
| 12 | MHC-II epitop keşfi -2 | |||
| 13 | Docking analizi-1 | |||
| 14 | Docking analizi-2 | |||
| 15 | Peptit aşı tasarımı | |||
| 16 | Final sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
• Computer-Aided Vaccine Design. • Epitope mapping protocols (Third Edition). • Ayrıca, etki değeri yüksek dergilerde yayınlanmış makaleler ders sırasında kaynak olarak kullanılacaktır.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 2 | 28 |
| Uygulama/Pratik | 14 | 2 | 28 |
| Proje Hazırlama | 14 | 2 | 28 |
| Proje Sunma | 14 | 2 | 28 |
| Proje Tasarımı /Yönetimi | 14 | 2 | 28 |
| Makale Kritik Etme | 14 | 1 | 14 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 3 | 42 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 3 | 3 | 9 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 3 | 3 | 9 |
| Okuma | 14 | 2 | 28 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 246 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | 4 | 4 | 4 | ||||
| ÖÇ 2 | 5 | ||||||
| ÖÇ 3 | 5 | ||||||
| ÖÇ 4 | 5 | 5 | |||||
| ÖÇ 5 | 5 | 5 | |||||
| ÖÇ 6 | 5 | ||||||
| ÖÇ 7 | 5 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek