GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 0 | 0 | 0 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Dersin Amacı
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Hedef protein saflaştırılması ile ilgili literatür tarama ve yorumlayabilme |
| 2 | Araştırma sonuçlarını değerlendirme, karşılaştırma ve yorumlayabilme |
| 3 | Uygun yöntem seçme becerisini kazanabilme |
| 4 | Kullanım amacına yönelik protein saflaştırma stratejileri tasarlayabilme ve geliştirebilme |
| 5 | Proteinlerin genel özellikleri ile hedef protein özellikleri arasında ilişki kurabilme |
| 6 | Kromatografik ve elektroforetik teknikleri ayırma ve protein dizi analizlerinde kullanılmasını kavrayabilme |
| 7 | Kullanılan yöntemlerin avantajlarını/dezavantajlarını irdeleyebilme ve karşılaştırabilme |
| 8 | Çağdaş sonuçları takip edebilme |
| 9 | Hedef proteinin saflaştırılmasında stratejik planlama yapabilme |
| 10 | Protein saflaştırılmasına yönelik yenilikleri takip edebilme ve spesifik yöntemleri geliştirebilme |
| 11 | Protein saflaştırılmasında kullanılan konvansiyonel biyokimyasal teknikleri anlama ve kullanabilme |
| 12 | Bireysel ve grup çalışması yapabilme |
Öğretim Sistemi
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
[Yok]
Dersin İçeriği
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Protein Saflaştırılmasının amacı ve ön planlama: Hedef proteinin kaynağı ve lokalizasyonu, miktarı, fizikokimyasal ve fiziksel özellikleri, saflaştırma amacı, protein saflaştırılmasının izlenmesi, | ||
| 2 | Protein saflaştırma stratejisi , Ön Ayırma teknikleri; 1. Hücre parçalama/ Homojenizasyon: Mekanik olmayan Teknikler: ısı ile parçalama, Freze-Thaw, Desikasyon, Osmotik şok, Litik enzimler, Alkali, Deterjanlar vb. | ||
| 3 | Ön Ayırma teknikleri;(Devam) Mekanik yöntemler: Blenderlar, homajenizatörler, öğütücüler, Aşındırıcılar ile agitasyon, Sıvı ve Katı Ekstrüsyon, Ultrasonikasyon | ||
| 4 | 2. Berraklaştırma; Santrifüj; Diferansiyal Santrifüj, Yoğunluk Gradient Santrifüj, Membran Filtrasyon teknikleri | ||
| 5 | 3. Ekstraktın deriştirilmesi: Ultrafiltrasyon, Liyofilizasyon, Çöktürme Yöntemleri( izoelektrik çöktürme, iyonik şiddeti değiştirerek çöktürme, organik çözgenler, Organik polimerler ve Denatürasyon ile çöktürme) | ||
| 6 | Kromatografik Yöntemler; Kromatografiye giriş ve sıvı kromatografisinde temel kavramlar, İyon değişim kromatografisi, | ||
| 7 | Kromatografik Yöntemler; Hidrofobik Etkileşim Kromatografisi, Jel Filtrasyon Kromatografisi, | ||
| 8 | Ara sınav | ||
| 9 | Kromatografik Yöntemler; Affinite kromatografisi: Biyospesifik, İmmunoafinite, Lektin afinite, Boya-ligant, Metal-Şelat, Kovalent afinite kromatografisi | ||
| 10 | Elektroforetik Yöntemler; Elektroforezin prensipleri, protein elektroforezi; PAGE, SDS-PAGE, IEF, 2D-PAGE. Blotlama, Immunustain, Görüntüleme ve değerlendirme | ||
| 11 | Karakterizasyon: Fonksiyonel Karakteristik; Proteinin biyolojik aktivitesine göre seçilecek teknikler, | ||
| 12 | Saflık kontrolü, Molekül kütle tayini ve IP tayini Amino asit analizi, N-, C- terminal analiz, vb. | ||
| 13 | Entegrasyon ve karşılaştırma, proteomik teknolojiler ve multidimensional teknikler | ||
| 14 | Dönem Projesi Sunumu | ||
| 15 | Dönem Projesi Sunumu | ||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Laboratuvar | 14 | 3 | 42 |
| Rehberli Problem Çözümü | 4 | 3 | 12 |
| Tartışma | 10 | 1 | 10 |
| Takım/Grup Çalışması | 14 | 2 | 28 |
| Rapor Hazırlama | 2 | 5 | 10 |
| Rapor Sunma | 2 | 1 | 2 |
| Proje Tasarımı /Yönetimi | 1 | 20 | 20 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 2 | 28 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Okuma | 10 | 2 | 20 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 238 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 4 | 5 | ||||
| ÖÇ 2 | 5 | 4 | |||||
| ÖÇ 3 | 4 | ||||||
| ÖÇ 4 | 5 | 4 | |||||
| ÖÇ 5 | 5 | ||||||
| ÖÇ 6 | 4 | ||||||
| ÖÇ 7 | 3 | ||||||
| ÖÇ 8 | 4 | ||||||
| ÖÇ 9 | 5 | ||||||
| ÖÇ 10 | 5 | ||||||
| ÖÇ 11 | 4 | 5 | |||||
| ÖÇ 12 | 5 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek