GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9101035332011 | Katalitik Nükleik Asitler | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 1 | 8,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu dersin amacı ribozim, deoksiribozim moleküllerinin tasarımı, katalizledikleri reaksiyonlar ve uygulama alanları hakkında bilgi verilmesidir.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof. Dr. Serap Evran
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Katalitik nükleik asitler ile ilgili yayınları okuyabilme, anlayabilme |
| 2 | Katalitik nükleik asitlerin tıptaki uygulama alanlarını kavrayabilme |
| 3 | Katalitik nükleik asitler ile ilgili güncel gelişmeleri takip edebilme |
| 4 | Katalitik nükleik asitlerin avantaj/dezavantajlarını yorumlayabilme |
| 5 | Deoksiribozim ve ribozimler ile ilgili temel kavramları anlayabilme |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Doğal ve yapay rizozimler tarafından katalizlenen reaksiyonlar, yapay rizozimlerin in vitro seçiminde uygulanan stratejiler, ribozim katalizinde proton transferi, grup I ve grup II intronlar, deoksiribozim katalizli kovalent modifikasyon ve DNA, RNA ligasyonu reaksiyonları, katalitik nükleik asitlerin katalitik parametreleri, mekanizma ve yapıları.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | DNA ve RNA yapısı | ||
| 2 | Nükleik asit aptamerleri | ||
| 3 | Riboswitch yapıları | ||
| 4 | Ribozim tanımı. Ribozim katalizinde proton transferi | ||
| 5 | Çekiç başı ve saç tokası rizobimlerinin yapısı ve kataliz | ||
| 6 | HDV Ribozim, glmS Ribozim | ||
| 7 | Grup I ve grup II intronlar | ||
| 8 | Ara sınav | ||
| 9 | Deoksiribozimler | ||
| 10 | Peroksidaz aktivitesi gösteren DNAzimler | ||
| 11 | Aptazimler | ||
| 12 | Öğrenci Sunumları | ||
| 13 | Öğrenci Sunumları | ||
| 14 | Öğrenci Sunumları | ||
| 15 | Öğrenci Sunumları | ||
| 16 | Final sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Lilley, D.M.J. and Eckstein, F., 2008. “Ribozymes and RNA Catalysis”. The Royal Society of Chemistry, Cambridge. Blackburn, G.M.,Gait, M.J., Loakes, D., Williams, D.M., 2006. “Nucleic Acids in Chemistry and Biology, Cambridge. The Aptamer Handbook: Functional Oligonucleotides and Their Applications, Sven Klussmann, Wiley‐VCH Verlag. Catalytically Active Nucleic Acids, Harald Seitz, Frank Stahl, Johanna-Gabriela Walter, 2020, Springer International Publishing. Li, Y. and Lu, Y. (2010) Functional nucleic acids for analytical applications. New York: Springer.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ev Ödevi | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Rapor Hazırlama | 4 | 5 | 20 |
| Rapor Sunma | 4 | 1 | 4 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 5 | 70 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 30 | 30 |
| Okuma | 14 | 4 | 56 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 246 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 5 | |||||
| ÖÇ 2 | 5 | 5 | |||||
| ÖÇ 3 | 5 | 5 | |||||
| ÖÇ 4 | 4 | 4 | |||||
| ÖÇ 5 | 4 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek