[GeriDon]

[DersOgretimPlani]

[DersinKodu] [DersinAdi] [DersinTuru] [Yil] [YariYil] [Ects]
9102015432010 Bitkilerde Gen Ekspresyonu ve Analiz Yöntemleri Seçmeli Ders Grubu 1 1 8,00

[DersinSeviyesi]

[YuksekLisans]

[DersDili]

Türkçe

[DersinAmaci]

Dersin Amacı Bu dersin amacı öğrencilerin; gen ekspresyonu mekanizmasının prokaryot ve ökaryot organizmalarda kavramasını , temel, aktif ve kromatin transkripsiyonda görev alan proteinlerin fonksiyonlarının anlaması, bitkilerde mRNA ların modifikasyonları, degradasyonu, lokalizasyonu, gen susturulması ve gen ekspresyonlarının regülasyonu ve analizleri hakkında temel bilgilere sahip olmasını sağlamaktır.

[DersiVerenGorevli]

Assist.Prof. Dr. Birsen ÇAKIR

[OgrenmeCiktilari]

1 Gen transfer tekniklerini öğrenebilmeli
2 Gen ekspresyonu temel bilgilerini kullanabilme yeteneğine sahip olma
3 Gen ekspresyonlarının işleyişi ve bitki fizyolojisi arasında ilişki kurabilme
4 Gen ekspresyonu analizlerini anlayabilme ve verilen bir sorun için uygun tekniği belirleyip kullanabilme ve çözüm üretebilme

[OgrenimTuru]

[DersOnKosulu]

Yok

[OnerilenDigerHususlar]

Yok

[DersinIcerigi]

Transkripsiyon, Kromatin ve gen susturulması, mRNAların oluşumu ve olgunlaşması, Gen ekspresyonlarının regülasyonu, Gen ekspresyonu analiz yöntemleri

[HaftalikDersIcerigi]

[Hafta] [Teorik] [Uygulama] [OgretimYontemVeTeknikleri] [OnHazirlik]
1 Gen ekspresyonuna genel bakış, Transkripsiyon RNA Polymeraz enzimleri seminer
2 Genlerin düzenleyici elementleri, Promoter The lac Operon Promoter The IL-2 Promoter Enhancer Silencer Response Elements seminer
3 Prokaryotlarda transkripsiyon mekanizması lac Operon nun regülasyonu Jel elektroforez tekniği
4 Ökaryotlarda transkripsiyon mekanizması Jel elektroforez tekniği
5 Transcription Faktörleri ve motifleri RNA izolasyonu tekniği
6 Histone acetilasyonu ve DNA metilasyonu PCR tekniği
7 Kromatin ve gen susturulması PCR tekniği
8 Arasınav
9 mRNAların oluşumu ve olgunlaşması Polyadenylation “Splicing” Taşınma Lokalizasyon Seminer
10 Gen ekspresyonlarının regülasyonu, Transkripsiyonel regülasyon Postranskripsiyonel regülasyon Seminer
11 Translasyonel ve posttranslasyonel regülasyon Seminer
12 Gen ekspresyonu analiz yöntemleri Transgenik bitki üretimi ile gen ekspresyonu analizi RT-PCR tekniği
13 Northern ve Dot blot analizleri Northern ve Dot blot tekniği
14 RT-PCR ve Real Time PCR seminer
15 Seminer seminer
16 Final sınavı

[DersKitabi]

1. Regulation of gene expression: molecular mechanisms, Gary H. Perdew, John P. Vanden Heuvel, Jeffrey ... - 2006 2. RNA and the Regulation of Gene Expression: A Hidden Layer of Complexity, Caister Academic Pres Edited by: Kevin V. Morris The Scripps Research Institute, La Jolla, USA 2008, ISBN: 978-1-904455-25-7 3. Practical Applications of Plant Molecular Biology (Paperback), R. J. Henry, Publisher: Chapman & Hall (January 1, 1997) , ISBN-10: 0412732203 4. Real-Time PCR: Current Technology and Applications, Julie Logan, Kirstin Edwards and Nick Saunders : 2009 ISBN: 978-1-904455-39-4

[PlanlananYontemler]

Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir.

[Degerlendirme]

Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri [Adet] [Deger]
Ara Sınav 1 100
[Toplam] 100
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri [Adet] [Deger]
Final Sınavı 1 100
[Toplam] 100
Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 40
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 60

[StajDurumu]

Yok

[IsYukuHesaplamasi]

[Etkinlikler] [Sayisi] [Suresi] [ToplamIsYuku]
Ara Sınav 1 2 2
Final Sınavı 1 2 2
Derse Katılım 14 2 28
Uygulama/Pratik 7 2 14
Laboratuvar 7 2 14
Seminer 1 7 7
Bireysel Çalışma 14 8 112
Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma 1 20 20
Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma 1 30 30
Ev Ödevi 2 10 20
[ToplamIsYuku] 249

[PCOCIliskisi]

[PC] 1 [PC] 2 [PC] 3 [PC] 4 [PC] 5 [PC] 6 [PC] 7
[OC] 1
[OC] 2
[OC] 3
[OC] 4
[PCOCAciklama]