GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9103105392014 | Uygulamalı Biyoinformatik | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 1 | 10,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Dersin amacı biyoinformatik bilimler ve ilişkili veri tabanları konusunda moleküler biyoloji verilerini kullanarak analizlar yapabilme yeteneği geliştirmek
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof.Dr. Kemal Sami Korkmaz
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Moleküler evrimi anlamak |
| 2 | Temel Biyoloji öğretiminde moleküler mekanizmalar konusunda fikir sahibi olmak ve nasıl kullanılacağını anlamak |
| 3 | Mikroarray verileri ve işlenmesini öğrenmek |
| 4 | Biyoinformatik kavramları tanımak |
| 5 | Translasyonun informatiğini öğrenmek |
| 6 | Transkripsiyonun informatiğini öğrenmek |
| 7 | Sistem Biyolojisi kavramları geliştirmek |
| 8 | Entrez veri tabanlarını ve kullanımını anlamak, BLAST ve karşılaştırmalı eşleştirme yapmayı öğrenmek |
Öğretim Sistemi
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Moleküler Biyoloji dersini almış olmak önerilir.
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Dersin içeriği haftalık planda detaylı olarak belirtilmiştir.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | DNA, RNA yapısı, Genlerin yapısı, Prokaryotlarda ve ökaryotlarda operon | ||
| 2 | DNAnın işlenmesi, Restriksiyon enzimleri, Klonlama, BLAST, | ||
| 3 | Transkripsiyon faktörleri, doku özgül ekspresyon paternleri ve Translasyonun mekanizmaları | ||
| 4 | Replikasyonun mekanizması ve faktörleri | ||
| 5 | Moleküler Biyolojik teknikler ve Genetik mühendislik, Veritabanlarına giriş | ||
| 6 | Karşılaştırmalı eşleştirme (Pairwise comparison) | ||
| 7 | Çoklu karşılaştırmalı eşleştirme (Multiple comparison) Clustal W kullanımı | ||
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | BLAST | ||
| 10 | BLAST algoritmaları, matrisler | ||
| 11 | Mikroarrayler ve gen ekspresyonu paternleri | ||
| 12 | veri analizleri ve istatistiksel anlamlandırma testleri | ||
| 13 | DNAnın evrimi ve farklı türlerin DNA düzeyinde karşılaştırılmaları, C değeri paradoksu | ||
| 14 | N değeri paradoksu ve gen dışı dizilerin evrimi | ||
| 15 | İnsan hastalıklarının evrimi | ||
| 16 | Final |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
NCBI sitesi web tutorial materyalleri
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir.
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 15 | 2 | 30 |
| Rehberli Problem Çözümü | 10 | 2 | 20 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 10 | 140 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 53 | 53 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 53 | 53 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 300 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| ÖÇ 2 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| ÖÇ 3 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| ÖÇ 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| ÖÇ 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| ÖÇ 6 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| ÖÇ 7 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| ÖÇ 8 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek