GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9105015172014 | Elektrokimyasal DNA Biyosensörleri | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 1 | 9,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Elektrokimyasal yöntemlerin temel ilkelerini ve bu yöntemlerin DNA biyosensörlerine uygulamalarını anlamak
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof. Dr. K. Arzum ERDEM GÜRSAN, Doç. Dr. Hakan KARADENİZ, Doç. Dr. Dilşat ARIKSOYSAL
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Elektrokimyasal yöntemlerin temel ilkelerinin anlaşılması. |
| 2 | Nükleik asitlerin yapısı ve özelliklerinin anlaşılması. |
| 3 | DNA dizilerinin elektrokimyasal yöntem ile tayininin anlaşılması. |
| 4 | Nükleik asitlere dayalı hastalıkların tanısının elektrokimyasal olarak algılanmasını anlamak. |
| 5 | Hastalıkların tayini için nükleik asitlere dayalı elektrokimyasal biyosensör dizaynını öğrenmek. |
Öğretim Sistemi
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
1. Elektrokimyanın Temel Kavramları; Genel Bilgi. 2. Biyosensör tanımı, algılama türüne göre çevirici sistemleri. 3. Nükleik asitlerin yapısı, işlevleri; PNA, RNA, mRNA, mikroRNA, SiRNA. 4. Polimer Zincir Tepkimesi (PZT); yapılışı, aşamaları, kullanılan malzemeler ve amaçları. 5. Biyosensör tasarımında kullanılan kavramlar; Primer, Prob, Hedef, tamamlayıcı (eşlenik), mutasyon, nokta mutasyonu, tam eşleşme. 6. DNA’nın yüzeye immobilizasyonu; elektrostatik, adsorpsiyon, kovalent bağlanma. 7. DNA probunun elektrot yüzeyine modifikasyonu. 8. Voltametrik ve empidimetrik yöntemler. 9. Kalıtsal ve bulaşıcı hastalık tayinine dayanan biyosensör tasarımı 10. Elektrokimyasal DNA biyosensörlerinin uygulamalarına yönelik güncel örnekler.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Elektrokimyanın Temel Kavramları; Genel Bilgi | ||
| 2 | Biyosensör tanımı, algılama türüne göre çevirici sistemleri. | ||
| 3 | Nükleik asitlerin yapısı, işlevleri; PNA, RNA, mRNA, mikroRNA, SiRNA. | ||
| 4 | Polimer Zincir Tepkimesi (PZT) ve aşamaları, kullanılan malzemeler, PZT nerede kullanılır? | ||
| 5 | Biyosensör tasarımında kullanılan kavramlar; Primer, Prob, Hedef, tamamlayıcı (eşlenik), mutasyon, nokta mutasyonu, tam eşleşme. | ||
| 6 | DNA’nın yüzeye immobilizasyonu; elektrostatik, adsorpsiyon, kovalent bağlanma. | ||
| 7 | DNA probunun elektrot yüzeyine modifikasyonu | ||
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | Voltametrik Yöntemler | ||
| 10 | Empidimetrik Yöntemler | ||
| 11 | Kalıtsal ve bulaşıcı hastalık tayinine dayanan biyosensör tasarımı | ||
| 12 | Kalıtsal ve bulaşıcı hastalık tayinine dayanan biyosensör tasarımı | ||
| 13 | Kalıtsal ve bulaşıcı hastalık tayinine dayanan biyosensör tasarımı | ||
| 14 | Elektrokimyasal DNA biyosensörlerinin uygulamalarına yönelik güncel örnekler. | ||
| 15 | Elektrokimyasal DNA biyosensörlerinin uygulamalarına yönelik güncel örnekler. | ||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1. Elizabeth, A., Hall, H., "Biosensors", Open University Press, (1990). 2. ELECTROCHEMICAL METHODS Fundamentals and Applications, Allen J. Bard and Larry R. Faulkner, JOHN WILEY & SONS, INC. second edition. 3. ARZUM ERDEM, Chapter 19: "Genosensor technology for electrochemical sensing of nucleic acids by using different transducers", Electrochemical Sensor Analysis-COMPREHENSIVE ANALYTICAL CHEMISTRY book, 2007, Volume 49 (ed. S. Alegret and A. Merkoci) pp. 403-411, Elsevier. 4. J. Wang, ‘Electrochemical Sensor Analysis’, Vol. 49, Algeret and Merckoci (Eds.), Elsevier, 2007. 5. Arzum ERDEM, Mehmet OZSOZ, Chapter 2: “Nucleic Acids as Biorecognition Element in Biosensor Development”, Nucleic Acid Biosensors for Environmental Pollution Monitoring, Ed. I. Palchetti and M. Mascini, Royal Society of Chemistry (UK), 2011, pages 17-33.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir.
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Quiz | 1 | 5 | 5 |
| Derse Katılım | 12 | 10 | 120 |
| Takım/Grup Çalışması | 2 | 6 | 12 |
| Rapor Hazırlama | 1 | 20 | 20 |
| Rapor Sunma | 1 | 2 | 2 |
| Seminer | 1 | 2 | 2 |
| Bireysel Çalışma | 1 | 35 | 35 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 35 | 35 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 35 | 35 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 270 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | 4 | 5 | |||||
| ÖÇ 2 | 4 | 5 | |||||
| ÖÇ 3 | 4 | 4 | 4 | ||||
| ÖÇ 4 | 4 | 5 | |||||
| ÖÇ 5 | 5 | 4 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek