GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9105015282020 | Sentetik Biyolojide Özel Konular | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Yaşamın modüler sistemini anlama Yaşamın parçalarının veya bütünün sentetik olarak yeniden yapımı veya yeniden dizaynını anlama
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof. Dr. Elif Esin HAMEŞ
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Sentetik biyoloji yaklaşımını anlayabilme |
| 2 | Biyolojik sistemlerin taklit edilmesi çalışmalarını anlayabilme |
| 3 | Sistem biyolojisinin modifikasyonunu anlama |
| 4 | Sentetik biyolojinin önemini kavrama |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
[Yok]
Dersin İçeriği
• Sentetik biyoloji tanımı diğer bilim dalları ile benzerlik ve farkları. Sentetik biyoloji alanında yapılan önemli çalışmalar, • Yaşamın modüler sistemi ve parçaları, küçük moleküller, metabolizma, makromoleküller, proteinler, aminoasitler, nükleik asitler, DNA çift heliks, RNA sekonder yapı, ribozim, polisakkaritler, central dogma, protein sentezi, genetik kod, kodon eğilimi, küçük molekül metabolizması, • Gen ifadesinin protein kontrolü, gen ifadesinin RNA kontrolü, riboswitch, RNAi, DNA paketlenmesi ile gen düzenlenmesi, epigenetik control. • Sentetik biyolojide beş çalışma alanı Minimal mikrop yapımı, DNA montaj hattı, Sıfırdan yapay hücre inşası, Yolak mühendisliği- Ucuz işgücü, Büyüyen yeryüzü genetik sistemi
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Sentetik biyoloji tanımı diğer bilim dalları ile benzerlik ve farkları | ||
| 2 | Sentetik biyoloji yayınları, projeleri ve aşamalar | ||
| 3 | Sentetik Biyolojide modüler sistem ve parçalar | ||
| 4 | Sentetik Biyoloji için Temel Bilgiler hücreler, küçük moleküller, metabolizma, makromoleküller | ||
| 5 | Protenler, aminoasitler, nükleik asitler, DNA çift heliks, RNA sekonder yapı, ribozim | ||
| 6 | Polisakkaritler ve modüler yapı, central dogma, protein sentezi | ||
| 7 | Genetik kod, kodon eğilimi, küçük molekül metabolizması | ||
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | Gen ifadesinin protein kontrolü, gen ifadesinin RNA ile kontrolü, riboswitch,RNAi | ||
| 10 | DNA paketlenmesi ile gen düzenlenmesi, epigenetik kontrol | ||
| 11 | Minimal mikrop yapımı, DNA montaj hattı, Sıfırdan yapay hücre inşası | ||
| 12 | Yolak mühendisliği- Ucuz işgücü, Büyüyen yeryüzü genetik sistemi | ||
| 13 | Ödev sunumları | ||
| 14 | Ödev Sunumları | ||
| 15 | Ödev Sunumları | ||
| 16 | Final |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
• Synthetic Biology: Tools for Engineering Biological Systems Edited by Daniel G. Gibson, J. Craig Venter Institute; Clyde A. Hutchison III, J. Craig Venter Institute; Hamilton O. Smith, J. Craig Venter Institute; J. Craig Venter, J. Craig Venter InstituteA Cold Spring Harbor Perspectives in Biology Collection 2017 • Benner, S.A., Sismour A.M. 2005. Synthetic biology Nature rewievs/genetics 6; 533. • Szostak, JW, Bartel DP, Luisi PL. 2001. Synthesizing life. Nature vol 409 • Isaacs, FJ, Dwyer, DJ, Collins JJ. 2006. RNA synthetic biology. Nature biotechnpology 24;5. • Drubin,DA., Way, J.C.,Silver, P.A. 2007.Designing biological systems Genes Dev. 21:242-254. • Extreme genetic engineering an introduction to synthetic biology, etc group 2007 • Canton, B., Labno A., Endy, D. 2008. Refinement and standardization of synthetic biological parts and devices. Nature biotechnology 26;7.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 80 |
| Ev Ödevi | 1 | 20 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 50 | 50 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 60 | 60 |
| Okuma | 1 | 10 | 10 |
| Ev Ödevi | 1 | 30 | 30 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 154 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | 4 | ||||||
| ÖÇ 2 | 4 | ||||||
| ÖÇ 3 | 4 | ||||||
| ÖÇ 4 | 4 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek