GERİ DÖN

Ders Öğretim Planı

Dersin Kodu Dersin Adı Dersin Türü Yıl Yarıyıl AKTS
9308055232020 Data Analizi ve Bİyoinformatik Seçmeli Ders Grubu 1 1 8,00

Dersin Seviyesi

Yüksek Lisans

Dersin Sunulduğu Dil

Dersin Amacı

Bu derste biyolojik verilerin türleri, üretilmesi, işlenmesi ve saklanması hakkında kapsamlı bilgi verilerek biyoinformatik biliminin temel prensiplerinin uygulamalı eğitimi amaçlanmaktadır.

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri

Öğrenme Çıktıları

Öğretim Sistemi

Birinci Öğretim

Dersin Ön Koşulu Olan Dersler

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

[Yok]

Dersin İçeriği

Biyoinformatik biliminin ortaya çıkması, tarihi ve geleceği. Biyolojik verilerin çeşitleri ve üretim tekniklerinin tanıtılması (Genomik ve Transkriptomik veriler, DNA-seq, RNA-seq, ChIP-seq, vb.). Analitik veri işleme hatları oluşturma, temel kodlama ve yazılım dizaynı için kullanılabilecek araçlar (R, python, bash, snakemake). Türüne özgü veri işlenmesi ve sonuçların yorumlanmasında dikkat edilmesi gereken hususlar (veri gürültüsü ayıklama, istatistiksel anlamlılık ve p-değeri, batch efekti düzeltme, vs.). Makine öğrenmesi yöntemlerinin biyoinformatik analizlerindeki yeri ve öneminin örneklerle işlenmesi.

Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği

Hafta Konular (Teorik) Uygulama Öğretim Yöntem ve Teknikleri Ön Hazırlık

Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları

Değerlendirme

Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri Adet Değer
Ara Sınav 1 100
Toplam 100
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri Adet Değer
Final Sınavı 1 100
Toplam 100
Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 40
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 60

Staj Durumu

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Toplam İş Yükü (saat) 0

Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi

PÇ 1 PÇ 2 PÇ 3 PÇ 4 PÇ 5 PÇ 6 PÇ 7 PÇ 8 PÇ 9 PÇ 10 PÇ 11 PÇ 12 PÇ 13 PÇ 14 PÇ 15 PÇ 16 PÇ 17
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek