GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9105035402016 | Mikrobiyal Ekolojide Moleküler Yöntemler | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 8,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu dersin amacı, moleküler mikrobiyal Ekolojide en yeni pratik ve teorik uygulamaları gerçekleştirmektir
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof.Dr. Güven Özdemir
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Çevresel örneklerde bulunan mikroorganizmaların moleküler analizlerini PCR, klonlama, dizileme kıyaslaması, FISH, DGGE…) gerçekleştirebilirler. |
| 2 | Mikrobiyal toplulukların anahtar organizmalarını tanılayabilirler ve sayısallandırabilirler |
| 3 | Farklı moleküler ve mikrobiyolojik analizlerin kuvvetli ve zayıf yönlerini açıklayabilirler |
| 4 | Mikrobiyal ekolojide rastlanan problemlere moleküler mikrobiyal ekoloji kavramlarını uygulayabilirler |
Öğretim Sistemi
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Mikrobiyal ekolojide moleküler devri; mikrobiyal çeşitlilik; rRNA yaklaşımı Mikropların moleküler tanılamada ve kantifikasyonunda son yenilikler Gen veritabanları ile çalışma, klon kütüphaneleri genetik finger printler Gen probları literatürleri ve web dünyası; probe dizaynı/değerlendirme
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Çevresel Örneklerde Nükleik asit ekstraksiyonu | ||
| 2 | Prokaryotik sistematiği: 16S rRNA PCR’ı and dizileme analizleri | ||
| 3 | Prokaryotik sistematiği: 16S rRNA PCR’ı and dizileme analizleri | ||
| 4 | Jenerasyon ve klon kütüphane analizleri | ||
| 5 | Klon kütüphanelerinin kantitatif analizler ve coverage | ||
| 6 | Klon kütüphanelerinin kantitatif analizler ve coverage | ||
| 7 | arasınav | ||
| 8 | Filogenetik inference | ||
| 9 | Filogenetik inference | ||
| 10 | Farklı moleküler tekniklere kıyasla filogenetik analizler | ||
| 11 | Mikrobiyal toplulukların DNA parmak izi | ||
| 12 | Çevresel izolatların moleküler tiplendirmesi | ||
| 13 | Çevresel izolatların moleküler tiplendirmesi | ||
| 14 | Çevresel izolatların moleküler tiplendirmesi | ||
| 15 | Çevresel izolatların moleküler tiplendirmesi | ||
| 16 | Final |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1- Molecular microbial ecology. Mark Osborn and Cindy Smith (eds). Published/Created: New York, NY : Taylor & Francis, c2005. 2- Madigan, M.T., Bender, K.S., Buckley, D.H., Sattley, W.M., Stahl, D.A., "Brock Biology of Microorganisms (15th Edition)"Benjamin Cummings, 2018.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir.
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 14 | 3 | 42 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Takım/Grup Çalışması | 14 | 2 | 28 |
| Rapor Hazırlama | 1 | 5 | 5 |
| Bireysel Çalışma | 30 | 2 | 60 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 4 | 8 | 32 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 5 | 8 | 40 |
| Okuma | 15 | 2 | 30 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 239 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 0 | |||||||
| ÖÇ 1 | |||||||
| ÖÇ 2 | |||||||
| ÖÇ 3 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek