GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9301096222004 | Protein-Protein Etkileşim Testleri | Seçmeli Ders Grubu | 2 | 3 | 9,00 |
Dersin Seviyesi
Doktora
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
“Protein – Protein Etkileşim Testleri” dersinin amacı ve hedefi farklı protein – protein etkileşim şekillerini tanımlamak, ve bu etkileşimlerin ortaya konması için kullanılan genetik ve biyokimyasal testler hakkında bilgi sahibi olmaktır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Assist. Prof. Dr. Buket Kosova
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Protein – Protein Etkileşim Testlerini sayabilme |
| 2 | Protein – Protein Etkileşimlerinin ortaya konulması için kullanılan genetik testler hakkında bilgi sahibi olma |
| 3 | Protein – Protein Etkileşimlerinin ortaya konulması için kullanılan biyokimyasal testler hakkında bilgi sahibi olma |
| 4 | Herbir Protein – Protein Etkileşim Testinin avantajını bilme |
| 5 | Herbir Protein – Protein Etkileşim Testinin dezavantajını bilme |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Genetik testler: Synthetic lethality, Suppressör taraması Biyokimyasal testler: Protein A pürifikasyonu, Two-hybrid screen, FRET teknolojisi, Protein microarray’leri
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Protein-Protein Etkileşim Testleri Dersine Giriş | ||
| 2 | Protein – Protein Etkileşimlerinin ortaya konması için kullanılan genetik testler | ||
| 3 | Sentetik letalite | ||
| 4 | Suppressör taraması | ||
| 5 | Protein – Protein Etkileşimlerinin ortaya konması için kullanılan biyokimyasal testler | ||
| 6 | Affinite pürifikasyonu | ||
| 7 | İki-hibrid taraması | ||
| 8 | FRET teknolojisi | ||
| 9 | Protein microarray’leri | ||
| 10 | Atomik kuvvet mikroskobisi | ||
| 11 | Kütle spektrometrisi | ||
| 12 | İki-boyutlu gel elektroforezi | ||
| 13 | Kimyasal çağraz bağlama | ||
| 14 | İmmunopresipitasyon | ||
| 15 | Herbir Protein-Protein Etkileşim Testinin avantajı | ||
| 16 | Herbir Protein-Protein Etkileşim Testinin dezavantajı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Golemis E., “A Molecular Manual: Protein – Protein Interactions” Cold Spring Harbor Laboratory Press (2002) Ders Notları Öğretim Üyesi tarafından dağıtılmaktadır
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Bütünleme Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 16 | 2 | 32 |
| Tartışma | 16 | 1 | 16 |
| Soru-Yanıt | 16 | 1 | 16 |
| Bireysel Çalışma | 16 | 8 | 128 |
| Ödev Problemleri için Bireysel Çalışma | 5 | 6 | 30 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 10 | 10 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Sözlü Sınav | 1 | 10 | 10 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 268 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | |
| ÖÇ 1 | 2 | 3 | 3 | |||||||
| ÖÇ 2 | 4 | 5 | 2 | 5 | ||||||
| ÖÇ 3 | 4 | 5 | 3 | 5 | ||||||
| ÖÇ 4 | 3 | 5 | 3 | 3 | 5 | |||||
| ÖÇ 5 | 2 | 5 | 3 | 3 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek