GERİ DÖN

Ders Öğretim Planı

Dersin Kodu Dersin Adı Dersin Türü Yıl Yarıyıl AKTS
9303076312010 Ekstraselüler Matriks ve İşlevleri Seçmeli Ders Grubu 1 1 4,00

Dersin Seviyesi

Doktora

Dersin Sunulduğu Dil

Türkçe

Dersin Amacı

Ekstraselüler matriks ve işlevleri dersinin amacı öğrencilerin; ekstraselüler matriksi (ESM) tanımlayabilmelerini, ESM bileşenlerini sınıflandırabilmelerini, ESM bileşenlerinin yapı ve işlevlerini sorgulayabilmelerini, ESM bileşenlerinin matriksi nasıl oluşturduğunu yorumlayabilmelerini, ESM bütünlüğünü sorgulayabilmelerini, ESM döngüsünü analiz edebilmelerini, ESM yıkımında rol alan enzimleri sınıflandırabilmeleri, ESM yıkım sürecinin kontrolünü yorumlayabilmelerini, ESM yıkımının fizyolojik ve patolojik süreçlerdeki önemini, ESM yıkımında rol alan matriks metalloproteinazları (MMP’ler) sorgulayabilmelerini, MMP’lerin doku inhibitörlerini sınıflandırabilmelerini, MMP’lerin ateroskleroskleroz patojenezindeki rollerini, ESM yeniden modellenmesinde hücre-hücre etkileşimlerini, ESM-hücre etkileşimlerini yorumlayabilmelerini, ESM ve reseptör aracılı sinyal iletimini sorgulayabilmelerini sağlamaktır.

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri

Assist. Prof. Dr. Buket REEL

Öğrenme Çıktıları

1 Ekstraselüler matriksi (ESM) tanımlayabilmelerini ve bileşenlerini sınıflandırabilme
2 ESM bileşenlerinin yapı ve işlevlerini sorgulayabilme
3 ESM bileşenlerinin matriksi nasıl oluşturduğunu yorumlayabilme
4 ESM bütünlüğünü sorgulayabilme
5 ESM döngüsünü analiz edebilme
6 ESM yıkımında rol alan enzimleri sınıflandırabilme
7 ESM yıkım sürecinin kontrolünü yorumlayabilme
8 ESM yıkımının fizyolojik ve patolojik süreçlerdeki önemini sorgulayabilme
9 ESM yıkımında rol alan matriks metalloproteinazları (MMP’ler) sorgulayabilme
10 MMP’lerin doku inhibitörlerini sınıflandırabilme
11 MMP’lerin ateroskleroskleroz patojenezindeki rollerini yorumlayabilme
12 ESM yeniden modellenmesinde hücre-hücre etkileşimlerini yorumlayabilme
13 ESM-hücre etkileşimlerini yorumlayabilme
14 ESM ve reseptör aracılı sinyal iletimini sorgulayabilme

Öğretim Sistemi

Birinci Öğretim

Dersin Ön Koşulu Olan Dersler

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Dersin İçeriği

1.Ekstraselüler matriksi (ESM) tanımlayabilmelerini ve bileşenlerini sınıflandırabilme 2.ESM bileşenlerinin yapı ve işlevlerini sorgulayabilme 3.ESM bileşenlerinin matriksi nasıl oluşturduğunu yorumlayabilme 4.ESM bütünlüğünü sorgulayabilme 5.ESM döngüsünü analiz edebilme 6.ESM yıkımında rol alan enzimleri sınıflandırabilme 7.ESM yıkım sürecinin kontrolünü yorumlayabilme 8.ESM yıkımının fizyolojik ve patolojik süreçlerdeki önemini sorgulayabilme 9.ESM yıkımında rol alan matriks metalloproteinazları (MMP’ler) sorgulayabilme 10.MMP’lerin doku inhibitörlerini sınıflandırabilme 11.MMP’lerin ateroskleroskleroz patojenezindeki rollerini yorumlayabilme 12.ESM yeniden modellenmesinde hücre-hücre etkileşimlerini yorumlayabilme 13.ESM-hücre etkileşimlerini yorumlayabilme 14.ESM ve reseptör aracılı sinyal iletimini sorgulayabilme

Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği

Hafta Konular (Teorik) Öğretim Yöntem ve Teknikleri Ön Hazırlık
1 Ekstraselüler matriks (ESM) nedir? •Tanım •Önemi Bileşenleri nelerdir? •Proteoglikanlar •Fibröz proteinler (Kollajen, Elastin) •Multiadezif matriks glikoproteinleri (Fibronektin, laminin)
2 ESM Bileşenlerinin Yapı ve işlevleri •Proteoglikanların yapı ve işlevleri •Kollajen, prokollajen ve elastik fibrillerin yapı ve işlevleri •Fibronektin ve diğer hücre interaktif glikoproteinlerinin yapı ve işlevleri
3 ESM bileşenleri matriksi nasıl oluşturuyor? •Proteoglikanların biyosentez ve katabolizması •Kollajenlerin biyosentezi, prokollajenlerin proteolitik prosesi
4 ESM bütünlüğü • Kollajen moleküllerinden matriks yapısına •Yapısal elementler, monomerler, multimerler, fibriller ve dokular
5 ESM döngüsü •ESM döngüsü nedir? •ESM döngüsünün dengesi neden önemli? •Bütünüğün bozulması ile ortaya çıkabilecek patolojiler
6 ESM yıkımında rol alan enzimler •Metalloproteinazlar •Serin proteinazlar •İntraselüler enzimler
7 ESM yıkım sürecinin kontrolü •Transkripsiyonel düzenleme •Latent proenzimlerin aktivasyonu •İnhibisyon
8 Arasınav
9 ESM yıkımının fizyolojik ve patolojik süreçlerdeki önemi •Yıkımın fizyolojik prosesleri •Patolojik süreçlerde ESM yıkımı
10 ESM yıkımında rol alan matriks metalloproteinazlar (MMP’ler) •MMP’lerin yapısı •MMP’lerin sınıflandırılması •MMP’lerin ekspresyonları •MMP’lerin yer aldığı fizyolojik ve patolojik süreçler •MMP enzim aktivitesinin düzenlenmesi
11 MMP’lerin doku inhibitörleri (TIMP’ler) •MMP enzim aktivitesinin doku inhibitörleri ile inhibisyonu •TIMP’lerin tipleri •TIMP’lerin özgüllükleri, benzer ve farklı yanları
12 MMP’lerin ateroskleroskleroz patojenezindeki rolleri •Erken aterosklerozdaki rolleri -Hücre proliferasyonunu ve migrasyonundaki rolleri •İleri aterosklerozdaki rolleri -Vasküler yeniden modellenme ve aterosklerotik plak kopmasındaki rolleri
13 ESM yeniden modellenmesinde hücre-hücre etkileşimleri Hücre adhezyon proteinleri •Selektinler •İntegrinler •İmmun globulin (Ig) süperailesi •Kadherinler
14 ESM-hücre etkileşimleri
15 ESM ve reseptör aracılı sinyal iletimi •İntegrin reseptörleri aracılı sinyal iletimi •Discoidin Domain Reesptörleri (DDR’ler) aracılı sinyal iletimi
16 Final sınavı

Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

1.Extracellular Matrix Vol 1 and Vol 2 Edited by Wayne D. Comper 1996. 2.Cell Biology of Extracellular Matrix 2. Edition Edited by Elizabeth D. Hay 1991. 3.Hücrenin Moleküler Biyolojisi 4. Baskı (Türkçe çeviri) Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter 2008.

Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları

Değerlendirme

Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri Adet Değer
Ara Sınav 1 100
Toplam 100
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri Adet Değer
Final Sınavı 1 100
Toplam 100
Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 40
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 60

Staj Durumu

Yok

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ara Sınav 1 1 1
Final Sınavı 1 2 2
Derse Katılım 14 2 28
Tartışma 5 2 10
Soru-Yanıt 2 3 6
Takım/Grup Çalışması 2 6 12
Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma 1 10 10
Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma 1 10 10
Okuma 14 2 28
Toplam İş Yükü (saat) 107

Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi

PÇ 1 PÇ 2 PÇ 3 PÇ 4 PÇ 5 PÇ 6
ÖÇ 1
ÖÇ 2
ÖÇ 3
ÖÇ 4
ÖÇ 5
ÖÇ 6
ÖÇ 7
ÖÇ 8
ÖÇ 9
ÖÇ 10
ÖÇ 11
ÖÇ 12
ÖÇ 13
ÖÇ 14
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek