BACK
Description of Individual Course Units
| Course Unit Code | Course Unit Title | Type of Course Unit | Year of Study | Semester | Number of ECTS Credits |
|---|---|---|---|---|---|
| 9303076312010 | Extracellular Martix and Functions | 1 | 2 | 4,00 |
Level of Course Unit
Third Cycle
Language of Instruction
Turkish
Objectives of the Course
The objective of this course is to provide students to be able to describe extracellular matrix (ECM) ESM, to classify its components , to questionize of the structure and functions of ECM, to interpret how ECM components constitute ECM, to questionize ECM integrity, to analize ECM turnover, to classify the enzymes which take a role in ECM degradation, to interpret the control of ECM degradation process, to questionize the importance of ECM degradation in physiological and pathological proceses, to questionize matrix metalloproteinases which take a role in ECM degradation, to classify tissue inhibitors of MMPs, to interpret the roles of MMPs in the pathogenesis of atherosclerosis, cell to cell interactions in ECM remodelling, ECM to cell interactions, to questionize ECM and receptor mediated signal transduction.
Name of Lecturer(s)
Learning Outcomes
| 1 | Ekstraselüler matriksi (ESM) tanımlayabilmelerini ve bileşenlerini sınıflandırabilme |
| 2 | ESM bileşenlerinin yapı ve işlevlerini sorgulayabilme |
| 3 | ESM bileşenlerinin matriksi nasıl oluşturduğunu yorumlayabilme |
| 4 | ESM bütünlüğünü sorgulayabilme |
| 5 | ESM döngüsünü analiz edebilme |
| 6 | ESM yıkımında rol alan enzimleri sınıflandırabilme |
| 7 | ESM yıkım sürecinin kontrolünü yorumlayabilme |
| 8 | ESM yıkımının fizyolojik ve patolojik süreçlerdeki önemini sorgulayabilme |
| 9 | ESM yıkımında rol alan matriks metalloproteinazları (MMP’ler) sorgulayabilme |
| 10 | MMP’lerin doku inhibitörlerini sınıflandırabilme |
| 11 | MMP’lerin ateroskleroskleroz patojenezindeki rollerini yorumlayabilme |
| 12 | ESM yeniden modellenmesinde hücre-hücre etkileşimlerini yorumlayabilme |
| 13 | ESM-hücre etkileşimlerini yorumlayabilme |
| 14 | ESM ve reseptör aracılı sinyal iletimini sorgulayabilme |
Mode of Delivery
Face to Face
Prerequisities and Co-Requisities
None
Recommended Optional Programme Components
None
Content of the Course
1.What is extracellular matrix? What are its components? 2.The structure and functions of ECM components 3.How ECM components constitute matrix? 4.The integrity of ECM 5.ECM turnover 6.The ezymes which take a role in ECM degradation 7.The control of ECM degradation process 8.The importance of ECM degradation in physiological and pathological proceses 9.Matrix metalloproteinases (MMPs) which take a role in ECM degradation 10.Tissue inhibitors of MMPs 11.The roles of MMPs in the pathogenesis of atherosclerosis 12.Cell to cell interactions in ECM remodelling 13.ECM to cell interactions 14.ECM and receptor mediated signal transduction.
Weekly Detailed Course Contents
| Week | Subjects (Theoretical) | Teaching Methods | Preparatory |
|---|---|---|---|
| 1 | Ekstraselüler matriks (ESM) nedir? •Tanım •Önemi Bileşenleri nelerdir? •Proteoglikanlar •Fibröz proteinler (Kollajen, Elastin) •Multiadezif matriks glikoproteinleri (Fibronektin, laminin) | ||
| 2 | ESM Bileşenlerinin Yapı ve işlevleri •Proteoglikanların yapı ve işlevleri •Kollajen, prokollajen ve elastik fibrillerin yapı ve işlevleri •Fibronektin ve diğer hücre interaktif glikoproteinlerinin yapı ve işlevleri | ||
| 3 | ESM bileşenleri matriksi nasıl oluşturuyor? •Proteoglikanların biyosentez ve katabolizması •Kollajenlerin biyosentezi, prokollajenlerin proteolitik prosesi | ||
| 4 | ESM bütünlüğü • Kollajen moleküllerinden matriks yapısına •Yapısal elementler, monomerler, multimerler, fibriller ve dokular | ||
| 5 | ESM döngüsü •ESM döngüsü nedir? •ESM döngüsünün dengesi neden önemli? •Bütünüğün bozulması ile ortaya çıkabilecek patolojiler | ||
| 6 | ESM yıkımında rol alan enzimler •Metalloproteinazlar •Serin proteinazlar •İntraselüler enzimler | ||
| 7 | ESM yıkım sürecinin kontrolü •Transkripsiyonel düzenleme •Latent proenzimlerin aktivasyonu •İnhibisyon | ||
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | ESM yıkımının fizyolojik ve patolojik süreçlerdeki önemi •Yıkımın fizyolojik prosesleri •Patolojik süreçlerde ESM yıkımı | ||
| 10 | ESM yıkımında rol alan matriks metalloproteinazlar (MMP’ler) •MMP’lerin yapısı •MMP’lerin sınıflandırılması •MMP’lerin ekspresyonları •MMP’lerin yer aldığı fizyolojik ve patolojik süreçler •MMP enzim aktivitesinin düzenlenmesi | ||
| 11 | MMP’lerin doku inhibitörleri (TIMP’ler) •MMP enzim aktivitesinin doku inhibitörleri ile inhibisyonu •TIMP’lerin tipleri •TIMP’lerin özgüllükleri, benzer ve farklı yanları | ||
| 12 | MMP’lerin ateroskleroskleroz patojenezindeki rolleri •Erken aterosklerozdaki rolleri -Hücre proliferasyonunu ve migrasyonundaki rolleri •İleri aterosklerozdaki rolleri -Vasküler yeniden modellenme ve aterosklerotik plak kopmasındaki rolleri | ||
| 13 | ESM yeniden modellenmesinde hücre-hücre etkileşimleri Hücre adhezyon proteinleri •Selektinler •İntegrinler •İmmun globulin (Ig) süperailesi •Kadherinler | ||
| 14 | ESM-hücre etkileşimleri | ||
| 15 | ESM ve reseptör aracılı sinyal iletimi •İntegrin reseptörleri aracılı sinyal iletimi •Discoidin Domain Reesptörleri (DDR’ler) aracılı sinyal iletimi | ||
| 16 | Final sınavı |
Text Book / Material / Recommended Resources
1.Extracellular Matrix Vol 1 and Vol 2 Edited by Wayne D. Comper 1996. 2.Cell Biology of Extracellular Matrix 2. Edition Edited by Elizabeth D. Hay 1991. 3.Molecular Biology of the cell 4. Edition (Turkish) Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter 2008.
Planned Learning Activities and Teaching Methods
Assessment Methods and Criteria
| Term (or Year) Learning Activities | Quantity | Weight |
|---|---|---|
| Midterm Examination | 1 | 100 |
| Total | 100 | |
| End Of Term (or Year) Learning Activities | Quantity | Weight |
| Final Examination | 1 | 100 |
| Total | 100 | |
| Term (or Year) Learning Activities | 40 | |
| End Of Term (or Year) Learning Activities | 60 | |
Work Pacement(s)
None
Workload Calculation
| Activities | Number | Time (hours) | Total Work Load (hours) |
|---|---|---|---|
| Midterm Examination | 1 | 1 | 1 |
| Final Examination | 1 | 2 | 2 |
| Attending Lectures | 14 | 2 | 28 |
| Discussion | 5 | 2 | 10 |
| Question-Answer | 2 | 3 | 6 |
| Team/Group Work | 2 | 6 | 12 |
| Individual Study for Mid term Examination | 1 | 50 | 50 |
| Individual Study for Final Examination | 1 | 62 | 62 |
| Reading | 14 | 7 | 98 |
| Total Work Load (hours) | 269 | ||
Contribution of Learning Outcomes to Programme Outcomes
| PO 1 | PO 2 | PO 3 | PO 4 | PO 5 | PO 6 | |
| LO 1 | ||||||
| LO 2 | ||||||
| LO 3 | ||||||
| LO 4 | ||||||
| LO 5 | ||||||
| LO 6 | ||||||
| LO 7 | ||||||
| LO 8 | ||||||
| LO 9 | ||||||
| LO 10 | ||||||
| LO 11 | ||||||
| LO 12 | ||||||
| LO 13 | ||||||
| LO 14 |
* Contribution Level: 1 Very low 2 Low 3 Medium 4 High 5 Very High