GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9101026522009 | Populasyonların Genetik Analizi | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 8,00 |
Dersin Seviyesi
Doktora
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu dersin amacı Mendel kuralları ve diğer genetik prensipleri populasyon seviyesinde incelemektir. Ders kapsamında zaman içinde evrimsel değişikliklerin oluşmasında etkili mekanizmalar ve aynı zamanda genetik varyasyonun tanımlanmasında önemli populasyon parametrelerinin hesaplanmaları da ele alınacaktır. Dersin konuları genetik modeller ve genetikte kantitatif yaklaşımlarla ilişkilendirilerek ele alınacaktır. bir bütün olarak ders genetik varyasyonun nasıl oluşturulduğu, sürdürüldüğü konularında klasik ve modern genetik tekniklere ait uygulamalar üzerinde yoğunlaşmaktadır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof. Dr. Nurşen Alpagut Keskin
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Populasyon genetiği ve moleküler evrimin temel prensiplerini kavramak |
| 2 | populasyon genetik verilerin analizinde kullanılan temel yaklaşımlar ile ilgili varsayımları kavramak |
| 3 | temel evrimsel süreçler ve gen bağlantısının populasyon içi ve arasında genetik varyasyon desenine etkilerini tanımlamak |
| 4 | populasyon genetiğinin disiplinler arası yaklaşımını kavramak |
| 5 |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Populasyon Biyolojisi, populasyonlar ve gen havuzları, populasyonların alt bölümleri, Populasyon genetiğinin tarihsel gelişimi, Olasılık ve değişkenler, Matematik modeller, ve populasyon genetiğinde kullanılan bilgisayar programları, Genetik varyasyon, Gen ve genotip frekansları, heterozigotluk, polimorfik lokuslar, allelik richness ve gen çeşitliliği, Hardy-Weinberg Prensibi, Klasik testler ve alternatif hipotezler, Rekombinasyon, Bağlantı ve Genetik dengesizlik, Doğal seleksiyon ve Dengelenmiş seleksiyon, populasyon üzerine etkileri: Temel ve Gelişmiş Modeller, Doğal populasyonlarda Mutasyonlar ve gen ve genotip frekanslarına etkileri, Doğal populasyonlarda Göçler ve gen ve genotip frekanslarına etkileri Doğal populasyonlarda random Genetik drift, Populasyon bölümlenmesi ve gen akışı, Moleküler populasyon genetiği, Nötral teori ve moleküler evrim, Multigen familyalarının evrimi ve trasposonlar, Moleküler saatler, genetik uzaklık ve divergens
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Laboratuvar | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Populasyon genetiği yaklaşımı, prensibi | |||
| 2 | Populasyon genetiği araştırmalarında proje tasarımı, veri eldesinde kullanılan yöntemler | |||
| 3 | populasyonlar ve gen havuzları | |||
| 4 | Gen ve genotip frekansları, Hardy-Weinberg Prensibi | |||
| 5 | Temel Evrimsel Süreçler ile ilgili kavramlar | |||
| 6 | Doğal Seçilim-Gen ve genotip frekansları üzerine etkileri | |||
| 7 | Mutasyon-Gen ve genotip frekansları üzerine etkileri | |||
| 8 | Arasınav | |||
| 9 | Gen Akışı-Gen ve genotip frekansları üzerine etkileri | |||
| 10 | Populasyonlar, genetik varyasyon ve örnekleme hatası | |||
| 11 | Genetik Drift-Gen ve genotip frekansları üzerine etkileri | |||
| 12 | Populasyon Yapılanması | |||
| 13 | Moleküler populasyon genetiği | |||
| 14 | Nötral Teori | |||
| 15 | Moleküler Saatler | |||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Hartl, D. L., 1988. “A primer of Population Genetics” (Second Edition). Sinauer Associates, Ins. Publishers Sunderland, Massachusetts. Halliburton R., 2004. “Introduction to Population Genetics.” Pearson Prentice Hall. Hartl D.L. and A.G. Clark. 1997. “Principles of Population Genetics.” 3rded. 1997. Sinauer Assoc. Hoelzel A. R., 1998. “Molecular Genetic Analysis of Populations” Oxford Univ. Press
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 2 | 28 |
| Laboratuvar | 14 | 2 | 28 |
| Problem Çözümü | 7 | 2 | 14 |
| Takım/Grup Çalışması | 6 | 2 | 12 |
| Rapor Hazırlama | 3 | 3 | 9 |
| Rapor Sunma | 3 | 1 | 3 |
| Proje Hazırlama | 3 | 5 | 15 |
| Proje Sunma | 2 | 1 | 2 |
| Makale Kritik Etme | 10 | 2 | 20 |
| Bireysel Çalışma | 8 | 2 | 16 |
| Ödev Problemleri için Bireysel Çalışma | 8 | 2 | 16 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 6 | 2 | 12 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 10 | 3 | 30 |
| Sözlü Sınav | 1 | 1 | 1 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 210 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | |||||||
| ÖÇ 2 | |||||||
| ÖÇ 3 | |||||||
| ÖÇ 4 | |||||||
| ÖÇ 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek