GERİ DÖN

---

---

Dersin Kodu	Dersin Adı	Dersin Türü	Yıl	Yarıyıl	AKTS
9101026482004	Mikrobiyal Genomik ve Proteomik Analizleri	Seçmeli Ders Grubu	1	2	8,00

---

Doktora

---

Dersin Sunulduğu Dil

Türkçe

---

Dersin Amacı

Bu dersin amacı, mikrobiyal genomik yöntemleri üzerine oldukça gelişmiş teknik bilgileri, genomik perspektiften bakarak mikrobiyal evolüsyon ilişkilerini irdelemek, ayrıca fonksiyonel genomik, metabolomik ve proteomik yöntemleri hakkında da detaylı bilgilere yer vermektir.

---

Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri

Prof.Dr. Füsun B. UÇAR

---

Öğrenme Çıktıları

1	Mikrobiyal sistemlerin evolüsyonu ile yapı ve fonksiyonlarının genom seviyesinde anlaşılması ilişkisini kurarak prokaryotik ve ökaryotik hücrelerin evrimini kavrayabilme becerisi geliştirmek
2	Mikrobiyal çeşitlilik ve genomik kavramlarının temelini öğrenmek ve bu bilgiyi identifikasyon çalışmalarında kullanabilme becerisi geliştirme
3	Tür kavramının geliştirilmesinde horizontal gen transferi, gen ve genom dublikasyonlarının mekanizmalarının önemini kavramak ve evrimdeki rollerini algılayabilme becerilerini kazanmak
4	Mikroorganizmaların genomlarının araştırılmasındaki moleküler biyolojik yöntemlerin kavranması ile prokaryotik ve ökaryotik hücrelerin ortak yönlerinin algılanması becerisinin kazanılması
5	Miroarray gibi yöntemlerin temellerinin bilinmesi ile gen fonksiyonları ve adaptasyon mekanizmalarının anlaşılabilme ilişkisinin kavranması
6	Proteomik yöntemlerin mekanizmalarının bilinmesi ile mikroorganizmaların proteinlerinin saptanması arasındaki ilişkilerin kurulabilmesi
7	Protein-protein ilişkilerinin saptanması ile mikroorganizmalardaki proteinlerin homolojilerinin anlaşılabilmesi
8	Bakteriyel patojenlerin ve çevrede yaşayan önemli mikroorganizmaların fonksiyonel genomik analizleri ile insan hastalıkları arasındaki ilişkinin kavranması

---

Öğretim Sistemi

---

Dersin Ön Koşulu Olan Dersler

Yok

---

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

---

Dersin İçeriği

Genomik: biyolojik sistemleri yapı, fonksiyon ve evolüsyonlarının genom seviyesinde anlaşılması; mikrobiyal çeşitlilik ve genomiks; genom annotation; genomik perspektiften mikrobiyal evolüsyon; genlerin fonksiyonel tahminlerini yapan yöntemler; DNA mikroarray teknolojileri; gen fonksiyonlarını çalışmak için mutasyon çalışmaları; kütle spektrofotometresi; protein-protein ilişkilerinin identifikasyonu; bakteriyel patojen ve çevrede yaşayan önemli mikroorganizmaların fonksiyonel genomik analizleri; antimikrobiyal ilaçlar üzerine genomik değerlendirme; horizontal gen transferleri; gen ve genom dublikasyonları; 3 domainin filogenetik ağaçlarının çizimleri

---

Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği

Hafta	Konular (Teorik)	Öğretim Yöntem ve Teknikleri	Ön Hazırlık

---

Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

• Zhiqiang An. Handbook of industrial mycology. Marcel Dekker, 2005 •Moore D., Frazer L.N., Essential fungal genetics. Springer, 2002. •Zhou J., Thompson D., Xu Y., Tiedje J.M., Microbial functional genomics. Wiley-lies, 2004. •Madigan, M.T., Martinko, J.M., Dunlap, P.V. and Clark, D. P., Biology of Microorganisms 12th Ed, Pearson. USA. 2009

---

Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları

Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir.

---

Değerlendirme

Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri	Adet	Değer
Ara Sınav	1	100
Toplam		100
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri	Adet	Değer
Final Sınavı	1	100
Toplam		100
Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri		40
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri		60

---

Staj Durumu

Yok

---

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ara Sınav	1	8	8
Final Sınavı	1	8	8
Rapor Hazırlama	6	3	18
Rapor Sunma	9	5	45
Makale Kritik Etme	12	6	72
Ödev Problemleri için Bireysel Çalışma	4	3	12
Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma	1	10	10
Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma	1	10	10
Okuma	14	3	42
Toplam İş Yükü (saat)			225

---

Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi

	PÇ 1	PÇ 2	PÇ 3	PÇ 4	PÇ 5	PÇ 6	PÇ 7
ÖÇ 1
ÖÇ 2
ÖÇ 3
ÖÇ 4
ÖÇ 5
ÖÇ 6
ÖÇ 7
ÖÇ 8