GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9101036422011 | Protein Katlanması | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 8,00 |
Dersin Seviyesi
Doktora
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu dersin amacı in vitro ve in vivo protein katlanma mekanizmaları, katlanma ve stabilite çalışmalarında kullanılan spektroskopik teknikler hakkında bilgi verilmesidir.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Doç. Dr. Serap EVRAN
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Protein katlanması ile ilgili yayınları okuyabilme ve anlayabilme |
| 2 | Proteinlerin yanlış katlanmasının yarattığı etkileri kavrayabilme. |
| 3 | Protein yapısı ve fonksiyon arasındaki ilişkinin önemini kavrayabilme. |
| 4 | Protein katlanmasına ilişkin kinetik ve termodinamik mekanizmalar hakkında temel kavramları açıklayabilme. |
| 5 | Protein katlanması ve stabilitesine ilişkin güncel gelişmeleri takip edebilme. |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Protein katlanmasına etki eden faktörler, in vivo protein katlanması, katlanmaya yardımcı olan proteinler, membran proteinlerinin katlanması, proteinlerin yanlış katlanması sonucu oluşan hastalıklar, protein katlanmasının ve stabilitesinin incelenmesinde spektroskopik teknikler, üre ve guanidin hidroklorür ile proteinlerin denatürasyonu, termal denatürasyon.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Proteinlerin sekonder ve tersiyer yapısı, protein katlanma ve stabilite çalışmalarının önemi | ||
| 2 | Protein katlanmasına ve stabilitesine etki eden faktörler | ||
| 3 | Protein katlanma problemi ve Levinthal paradoksu | ||
| 4 | Protein katlanma mekanizmaları | ||
| 5 | Protein katlanma çalışmalarında kullanılan spektroskopik teknikler | ||
| 6 | Proteinlerin üre ve guanidin hidroklorür ile denatürasyonu. | ||
| 7 | In vivo protein katlanması. Şaperon proteinler | ||
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | Membran proteinlerinin katlanması | ||
| 10 | Multi-domain ve oligomerik proteinlerin katlanması | ||
| 11 | Proteinlerin yanlış katlanması | ||
| 12 | Öğrenci Sunumları | ||
| 13 | Öğrenci Sunumları | ||
| 14 | Öğrenci Sunumları | ||
| 15 | Öğrenci Sunumları | ||
| 16 | Final sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Buchner, J., Kiefhaber, T., 2005, “Protein Folding Handbook”. WILEY-VCH Verlag GmbH ve Co. KGaA, Weinheim. Nölting, B., 2005, “Protein Folding Kinetics: Biophysical Methods”. Springer-Verlag Berlin Heidelberg. Whitford, D., 2005, “Proteins Structure and Function”. WILEY-VCH Verlag GmbH ve Co. KGaA, Weinheim. Protein Folding: An Introduction (SpringerBriefs in Molecular Science), Cláudio M. Gomes, Patrícia F.N. Faísca, 2019, Springer.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Soru-Yanıt | 14 | 1 | 14 |
| Rapor Hazırlama | 1 | 25 | 25 |
| Rapor Sunma | 1 | 2 | 2 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 4 | 56 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 25 | 25 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 30 | 30 |
| Okuma | 14 | 2 | 28 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 226 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 5 | |||||
| ÖÇ 2 | 4 | ||||||
| ÖÇ 3 | 4 | 4 | |||||
| ÖÇ 4 | 4 | 4 | |||||
| ÖÇ 5 | 4 | 5 | 5 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek