GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9101036242012 | İleri Biyokimyasal Teknikler | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 8,00 |
Dersin Seviyesi
Doktora
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Biyolojik bilimlerdeki gelişmeler büyük ölçüde ölçme ve gözlemleme teknolojilerindeki hızlı gelişmelere bağlıdır. Bu yeni teknolojiler , enstrumental metodlar ve analitik/endüstriyel proseslerin temel prensipleri hakkında bilgi sahibi olmak, araştırmalarda uygun cihaz ve yöntem seçiminde kaliteli güvenilir sonuçlara ulaşmak için gereklidir. Bu ders kapsamında öğrencilere biyokimyada ileri teknikler hakkında temel bilgilerin verilmesi ve biyomoleküllerin analizinde ileri düzeyde pratik düşünce yeteneği kazandırılması temel amaçtır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof.Dr. Figen Zihnioglu
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Modern biyokimyasal teknikleri anlayabilme ve araştırma deneyimi kazanabilme becerisi |
| 2 | Modern biyokimyasal enstrumantal tekniklerinin temel prensiplerini açıklayabilme, işletme ve uygulama koşullarını kavrayabilme |
| 3 | Enstrumantasyon teknolojisindeki yeni gelişmeleri anlayabilme |
| 4 | Biyomoleküllerin kantitatif ve kalitatif değerlendirilmesinde ve saflaştırılmasında bakış açısı kazanma becerisi |
| 5 | Modern biyokimya laboratuvarlarında yeni diyagnostic araçları anlayabilme |
| 6 | Bilimsel rapor/ proje hazırlayabilme becerisi |
| 7 | Yeni teknikleri takip edebilme ve seçebilme becerisi |
Öğretim Sistemi
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Ders kapsamında öncelikle son yıllardaki gelişmelere dayalı olarak bazı biyokimyasal tekniklerin temel prensipleri verilecektir. HPLC ve electroforetik tekniklerin kantitatif ve yapı analizlerinde kullanımları, ileri kütle spektrometrik teknikler ve biyokimyadaki uygulamaları, elektrotransfer, immunostain teknikleri, multidimensional teknikler, kararlı izotop işaretleme teknikleri, görüntüleme teknikleri, 3D yapı analizi ve tahmini, X-Işınları kristalografisi, immunobiyokimyasal teknikler, microarrayler vb.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | LC-MS/MS, CE-MS/MS gibi Hypnated tekniklerin temel prensipleri ve uygulamaları | ||
| 2 | İleri Kütle Spektrometrik Tekniklerin temel prensipleri ve uygulamaları; Örn;MALDI-TOF, ESI-TOF, SELDI-TOF vb. | ||
| 3 | Multidimensional Tekniklerin temel prensipleri ve uygulamaları; örn; 2D-PAGE, 2D-DIGE, 2D-LC | ||
| 4 | Kararlı İzotop işaretleme tekniklerinin temel prensipleri ve uygulamaları; Örn: ICAT, SILAC, vb. | ||
| 5 | Immunostaining tekniklerin temel prensipleri ve uygulamaları; örn; ELISA, RIA vb. | ||
| 6 | Spectral Tekniklerin temel prensipleri ve uygulamaları; Örn; Floresans, NMR, CD, FRET, vb. | ||
| 7 | Tartışma ve Seminer | ||
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | X-Işınları Kristalografisinin temel prensipleri ve uygulamaları | ||
| 10 | Görüntüleme tekniklerinin temel prensipleri ve uygulamaları; Örn; Cyro M, Immuno floresans vb. | ||
| 11 | Mikroarraylerin temel prensipleri ve uygulamaları; DNA arrayler, protein arrayler, glycoarrayler | ||
| 12 | Tartışma ve seminer | ||
| 13 | Tekniklerin karşılaştırılması ve değerlendirme; rehberli problem çözümü | ||
| 14 | Proje sunumu | ||
| 15 | Proje sunumu | ||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
A.Pingoud, C.Unbanke, J.Hogget, A.Jeltsch,“Biochemical Methods”,Wiley-VCH, (2001) J. P. Chapman, “Mass Spectrometry of Proteins and Peptides”, Humana Press, Totowa NJ, (2000) Textbooks and related articles will be chosen according to the developments Please consult your lecturer
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir.
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 3 | 3 |
| Final Sınavı | 1 | 3 | 3 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Rehberli Problem Çözümü | 3 | 3 | 9 |
| Tartışma | 3 | 3 | 9 |
| Proje Hazırlama | 1 | 20 | 20 |
| Proje Sunma | 1 | 2 | 2 |
| Seminer | 2 | 3 | 6 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 3 | 42 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 15 | 15 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 25 | 25 |
| Okuma | 14 | 4 | 56 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 232 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | ||
| ÖÇ 2 | 4 | 5 | 4 | 4 | |||
| ÖÇ 3 | 5 | 5 | |||||
| ÖÇ 4 | 4 | 4 | |||||
| ÖÇ 5 | 5 | ||||||
| ÖÇ 6 | 4 | 2 | |||||
| ÖÇ 7 | 4 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek