GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9101046502017 | Moleküler Modelleme Yazılımları | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 8,00 |
Dersin Seviyesi
Doktora
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Muhtelif moleküler modelleme yazılımlarının kullanımının ana hatlarını öğrenmek, bu yazılımların giriş/çıkış formatlarının arasındaki bağlantıları anlamak, bunlar arasında gerekli format dönüşümlerini yapabilmek, bu yazılımlarla, bazı moleküllerin moleküler yapılarının aydınlatılması ve titreşimsel spektrumlarının analiz edilmesi.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Moleküler modelleme yazılımlarını kullanabilme |
| 2 | İlgili yazılımlarda Giriş dosyalarını hazırlayabilme |
| 3 | Yapılacak modellemelerin sonuçlarını ilgili yazılımlarla yorumlayabilme |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Moleküler modelleme yazılımlarından; LEV, PQS, ArgusLab, Hyperchem, Gaussian, Avogadro, Babel vb. yazılımların kullanımları ve ayrıntıları işlenecektir.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | LEV yazılımı | ||
| 2 | Gaussian yazılımı-Avogadro yazılımı | ||
| 3 | ArgusLab yazılımı | ||
| 4 | Hyperchem yazılımı | ||
| 5 | Moleküler modelleme yazılımları arasında format dönüştürme | ||
| 6 | Alıştırmalar 1 (Gaussian-Hyperchem-ArgusLab-LEV-Avogadro) | ||
| 7 | Alıştırmalar 2 (Gaussian-Hyperchem-ArgusLab-LEV-Avogadro) | ||
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | Yazılımlar ile moleküler hesaplamalar | ||
| 10 | Moleküler titreşim modlarına ait toplam enerji dağılımlarını veren yazılımların incelenmesi | ||
| 11 | Yazılımlar ile hesaplanan moleküler yapı ve spektrumların analizi | ||
| 12 | Sonuçların incelendiği yazılımlar 1 | ||
| 13 | Sonuçların incelendiği yazılımlar 2 | ||
| 14 | İleri alıştırmalar 1 (Gaussian-Hyperchem-ArgusLab-LEV-Avogadro) | ||
| 15 | İleri alıştırmalar 2 (Gaussian-Hyperchem-ArgusLab-LEV-Avogadro) | ||
| 16 | Final sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1) Gaussian, Hyperchem, LEV, ArgusLab, Avogadro el kitapları. 2) Molecular Modeling Laboratory, Edyta Dyguda-Kazimierowicz
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir.
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Mümkün
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 3 | 3 |
| Final Sınavı | 1 | 3 | 3 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Rapor Sunma | 8 | 6 | 48 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 3 | 42 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 8 | 2 | 16 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 8 | 2 | 16 |
| Okuma | 14 | 5 | 70 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 240 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | |||||||
| ÖÇ 2 | |||||||
| ÖÇ 3 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek