GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9102026242008 | İleri Fitobakteriyoloji | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 8,00 |
Dersin Seviyesi
Doktora
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu dersin amacı, bitki patojeni ve yararlı bakterilerin modern tanılama tekniklerini kullanarak ileri düzeyde tanısını gerçekleştirmek, bitki patojeni bakterilerin hastalık oluşturma mekanizmalarını tartışmak, bakteri metabolizmasını tanıtmak ve öğrencilerin bu metodları kullanarak bu konudaki bir sorunun çözümü için testler yürütmesini ve rapor düzenlemesini sağlamaktır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Farklı özellikleri dikkate alınarak bitki patojeni ve yararlı bakterileri ayırt edebilme |
| 2 | Bitki örneklerindeki patojenik olan ve olmayan bakterilerin modern teşhis ve tanılama yöntemlerini kullanabilme ve kıyaslayabilme |
| 3 | Modern teşhis ve tanılama yöntemleri ile çalışabilme ve ekipmanları kullanabilme |
| 4 | Bitki patojeni bakterilerin hastalık oluşturma mekanizmasını teorik ve deneysel olarak algılayabilme |
| 5 | Bakterilerin metabolizmasını ve bitki patolojisi açısından işlevlerini öğrenebilme |
| 6 | Bakteriyel metabolitleri kalitatif ve kantitatif olarak saptayabilme |
| 7 | Konu ile ilgili çalışmalar düzenleyebilme ve sonuçları raporlayabilme |
Öğretim Sistemi
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Ders, Lisansüstü eğitime devam eden ve Lisansüstü eğitimde Temel Bakteriyoloji dersini almış olan öğrencilere yöneliktir.
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Bu dersin Birinci bölümünde, Biyokimyasal, serolojik ve moleküler ileri tanı tekniklerini teorik ve uygulamalı olarak tanıtmak hedeflenmektedir. İkinci Bölümde; bitki patojeni bakterilerin patogenezisi, önemli bakteriyel hastalık etmenleri temel alınarak yine teorik ve uygulamalı olarak tanıtılmaktadır. Üçüncü Bölümde ise; bitki patojeni bakterilerin hastalık oluşumunda rol oynayan metabolitleri teorik ve deneysel anlamda anlatılmaktadır.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Uygulama | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Dersin tanıtımı, Bitki patojeni bakterilerin özellikleri ve sınıflandırılması, bakteri tanısı konusunda genel bilgiler | Konuyla ilgili okuma ve deneysel uygulama | ||
| 2 | bakteri tanısında kullanılan modern yöntemler • biyokimyasal ve metebolik özelliklerine göre bakterilerin tanısı (API, BIOLOG Tanı kitleri kullanılarak) | Konuyla ilgili okuma ve deneysel uygulama | ||
| 3 | bakteri tanısında kullanılan modern yöntemler • protein ve lipopolisakkarit analizlerine göre bakterilerin tanısı ( sds page, southern blot, northern blot analizi) | Konuyla ilgili okuma ve deneysel uygulama | ||
| 4 | bakteri tanısında kullanılan modern yöntemler • serolojik yöntemlerle bakterilerin tanısı (antijen ve antiserum eldesi, serolojik tanı testlerinin genel özellikleri) | Konuyla ilgili okuma ve deneysel uygulama | ||
| 5 | bakteri tanısında kullanılan modern yöntemler serolojik yöntemlerle bakterilerin tanısı (ımmuno izolasyon tekniği, Immunofluoresens tekniği, ELISA tekniği) | Konuyla ilgili okuma ve deneysel uygulama | ||
| 6 | bakteri tanısında kullanılan modern yöntemler • yağ asitleri profillerine göre bakterilerin tanısı • bakteriyofaj ile tanı | Konuyla ilgili okuma ve deneysel uygulama | ||
| 7 | bakteri tanısında kullanılan modern yöntemler • nükleik asit temelli mikrobiyal tanı yöntemleri • DNA ekstraksiyonu • PCR temelli metodlar (Klasik PCR) | Konuyla ilgili okuma ve deneysel uygulama | ||
| 8 | Arasınav | |||
| 9 | bakteri tanısında kullanılan modern yöntemler • nükleik asit temelli mikrobiyal tanı yöntemleri • PCR temelli metodlar (REP PCR, Bio PCR,Real Time PCR) | Konuyla ilgili okuma ve deneysel uygulama | ||
| 10 | bitki patojeni bakterilerde hastalık oluşumu (patogenesis), patojenisite testleri • inokulum hazırlığı • Koparılmış bitki organlarında patojenisite testleri • Kanser patojenleri için patojenisite testleri • Yaprak, gövde, meyve vb. leke ve yanıklık patojenleri için patojenisite testleri | Konuyla ilgili okuma ve deneysel uygulama | ||
| 11 | bitki patojeni bakterilerde hastalık oluşumu (patogenesis), patojenisite testleri • Solgunluk patojenleri için patojenisite testleri • Yumuşak çürüklük patojenleri için patojenisite testleri • Ur, gal oluşturan bakteriler için patojenisite testleri | Konuyla ilgili okuma ve deneysel uygulama | ||
| 12 | bitki patojeni bakterilerin hastalık oluşumunda rol oynayan metabolitlerinin saptanması (pato-fizyoloji) • Bakteriyel Enzimler (Pektolitik, proteolitik) | Konuyla ilgili okuma ve deneysel uygulama | ||
| 13 | bitki patojeni bakterilerin hastalık oluşumunda rol oynayan metabolitlerinin saptanması (pato-fizyoloji) • Bakteriyel toksinler, • Bakteriyel Hormonlar (IAA, Sitokinin) | Konuyla ilgili okuma ve deneysel uygulama | ||
| 14 | bitki patojeni bakterilerin hastalık oluşumunda rol oynayan metabolitlerinin saptanması (pato-fizyoloji) • Bakteriyel Pigmentler (Siderofor, Xanthin) • Bakteriyel buz Çekirdeği oluşturma Aktivitesi (INA) | Konuyla ilgili okuma ve deneysel uygulama | ||
| 15 | Dönem projesi sunumları | |||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Fahy,P.C., Persley,G.J., 1983. PLANT BACTERIAL DISEASES. A Diagnostic Guide. AP, 393s. Gnanamanickam,S.S., 2006. PLANT-ASSOCIATED BACTERIA. Springer Pub., 712 s. Klement,Z., Rudolph,K., and Sands,D.C., 1990. METHODS IN PHYTOBACTERIOLOGY. Akademiai kiado, Budapest, 568s. Lelliott,R.A., and Stead,D.E., 1987. METHODS IN PLANT PATHOLOGY, VOLUME 2: Methods for the Diagnosis of Bacterial Diseases of Plants. Blackwell Scientific Publ., 216s. Saygılı,H., Şahin,F., Aysan,Y., 2006. FİTOBAKTERİYOLOJİ. Meta Basımevi, 530s. Schaad, N.W., Jones,J.B.,Chun,W., 2001. Laboratory Guide for Identification of PLANT PATHOGENIC BACTERIA. APS Press, third edition,373s. Watson et al., 2004. MOLECULAR BIOLOGY OF THE GENE. Fifth Edition, CSHL Press:711s
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir.
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Quiz | 4 | 1 | 4 |
| Derse Katılım | 14 | 2 | 28 |
| Uygulama/Pratik | 14 | 2 | 28 |
| Örnek Vaka İncelemesi | 4 | 9 | 36 |
| Proje Hazırlama | 1 | 30 | 30 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 3 | 42 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 30 | 30 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 40 | 40 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 238 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | |
| ÖÇ 1 | |||||||
| ÖÇ 2 | |||||||
| ÖÇ 3 | |||||||
| ÖÇ 4 | |||||||
| ÖÇ 5 | |||||||
| ÖÇ 6 | |||||||
| ÖÇ 7 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek