GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| 9103016322019 | Biyoinformatik Algoritmaları | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 10,00 |
Dersin Seviyesi
Doktora
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu dersin amacı, öğrencilerin biyoinformatik alanındaki temel kavramları anlamalarını, biyoinformatik alanındaki ana problemleri ve biyoinformatik alanında kullanılan önemli yöntem ve araçları öğrenmelerini sağlamaktır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Biyoinformatik alanındaki temel kavramları kavrayabilme |
| 2 | Biyoinformatik alanındaki ana problemleri kavrayabilme |
| 3 | Biyoinformatik alanında kullanılan önemli yöntem ve araçları öğrenebilme |
| 4 | Biyolojik veri üzerinde algoritmalar tasarlayabilme ve uygulayabilme |
| 5 | Biyoinformatik alanında yapılan en son araştırmaları takip edebilme |
| 6 | Biyoinformatik alanında yeni araştırmalar yapabilme |
Öğretim Sistemi
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Algoritmalar ve Karmaşıklık, Moleküler Biyoloji’ye Giriş, İleri Arama Algoritmaları, Greedy Algoritmaları, Dinamik Programlama Algoritmaları, Böl ve Fethet Algoritmaları, Çizge Algoritmaları, Kombinatoryal Desen Eşleştirme, Kümeleme ve Ağaçlar, Saklı Markov Modelleri, Randomize Algoritmalar
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Giriş | ||
| 2 | Algoritmalar ve Karmaşıklık | ||
| 3 | Moleküler Biyoloji’ye Giriş | ||
| 4 | İleri Arama Algoritmaları | ||
| 5 | Greedy Algoritmaları | ||
| 6 | Dinamik Programlama Algoritmaları | ||
| 7 | Dinamik Programlama Algoritmaları | ||
| 8 | Böl ve Fethet Algoritmaları | ||
| 9 | Ara Sınav | ||
| 10 | Çizge Algoritmaları | ||
| 11 | Kombinatoryal Desen Eşleştirme | ||
| 12 | Kümeleme ve Ağaçlar | ||
| 13 | Saklı Markov Modelleri | ||
| 14 | Randomize Algoritmalar | ||
| 15 | Gözden Geçirme | ||
| 16 | Final Sınavı |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
• An Introduction to Bioinformatics Algorithms, Neil Jones & Pavel Pevzner, MIT Press, 2004. • M. Zvelebil and J. O. Baum, Understanding Bioinformatics, Garland Science, 2008.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir.
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Proje Hazırlama | 3 | 40 | 120 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 40 | 40 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 40 | 40 |
| Okuma | 14 | 3 | 42 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 288 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | |
| ÖÇ 1 | 3 | ||||||||||
| ÖÇ 2 | 3 | ||||||||||
| ÖÇ 3 | 3 | 3 | |||||||||
| ÖÇ 4 | 4 | 3 | 4 | ||||||||
| ÖÇ 5 | 4 | 4 | 3 | ||||||||
| ÖÇ 6 | 3 | 4 | 3 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek